17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2649 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_2649  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 		 267 aa  551  1e-156  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0855  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.09 
 
 		 863 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252083  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0859  dead/deah box helicase domain protein  40.09 
 
 		 863 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000405293 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19790  superfamily II helicase  33.72 
 
 		 852 aa  134  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3383  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.48 
 
 		 868 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.865687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0511  DEAD/DEAH box helicase  34.2 
 
 		 869 aa  124  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.396939  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1150  DEAD/DEAH box helicase-like  28.52 
 
 		 858 aa  100  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.794218  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4837  putative dead/deah box helicase domain protein  31.67 
 
 		 849 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.907663 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3112  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  41.51 
 
 		 828 aa  73.6  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.471561 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1048  helicase domain protein  32.76 
 
 		 729 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3328  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.98 
 
 		 717 aa  52  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.953553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2426  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.94 
 
 		 856 aa  47.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00467654  normal  0.444529 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4440  hypothetical protein  44.83 
 
 		 141 aa  45.8  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0781  helicase-like  24.35 
 
 		 699 aa  45.4  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.137503  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1987  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.35 
 
 		 1064 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0686231  normal  0.184545 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2029  helicase domain-containing protein  32.97 
 
 		 711 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.434409  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1063  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.87 
 
 		 1032 aa  42.4  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>