39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_0590 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3861  polysulphide reductase NrfD  96.39 
 
 
360 aa  696    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.773503 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0590  polysulphide reductase NrfD  100 
 
 
360 aa  717    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0663  polysulphide reductase, NrfD  96.39 
 
 
360 aa  694    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3735  polysulphide reductase NrfD  97.78 
 
 
360 aa  703    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3678  Polysulphide reductase NrfD  97.22 
 
 
360 aa  702    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0634  polysulphide reductase, NrfD  85.15 
 
 
364 aa  590  1e-167  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00082842 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0634  polysulphide reductase, NrfD  83.84 
 
 
364 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00221682 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1740  putative tetrathionate reductase subunit C  36.72 
 
 
361 aa  177  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003033  tetrathionate reductase subunit C  35.92 
 
 
376 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1068  polysulphide reductase NrfD  40.17 
 
 
352 aa  160  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177902 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0898  tetrathionate reductase, subunit C  34.84 
 
 
342 aa  152  5.9999999999999996e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.392425  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1424  Polysulphide reductase NrfD  36 
 
 
348 aa  149  7e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.270293  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2423  polysulphide reductase, NrfD  36.27 
 
 
348 aa  145  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00497953  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1518  tetrathionate reductase complex subunit C  34.55 
 
 
340 aa  143  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000105218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1787  tetrathionate reductase complex, subunit C  34.55 
 
 
340 aa  143  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1481  tetrathionate reductase complex subunit C  34.55 
 
 
340 aa  143  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.393478 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1958  tetrathionate reductase complex, subunit C  34.27 
 
 
340 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.413721  hitchhiker  0.000000744183 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1497  tetrathionate reductase complex, subunit C  34.27 
 
 
340 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000345555 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4245  polysulphide reductase NrfD  34.22 
 
 
347 aa  120  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.370954  normal  0.113587 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1798  Polysulphide reductase NrfD  26.39 
 
 
391 aa  80.1  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4782  Polysulphide reductase NrfD  28.11 
 
 
400 aa  72  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2141  Polysulphide reductase NrfD  30.41 
 
 
330 aa  58.2  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0724041  normal  0.879505 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1196  Polysulphide reductase NrfD  25.65 
 
 
348 aa  55.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0618  formate-dependent nitrite reductase membrane component-like  27.81 
 
 
330 aa  55.8  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0787087  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0910  Polysulphide reductase NrfD  26.79 
 
 
330 aa  54.7  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.241015  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1162  Polysulphide reductase NrfD  28.8 
 
 
323 aa  53.1  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130935  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1865  Polysulphide reductase NrfD  28.96 
 
 
304 aa  53.1  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0342025 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2044  polysulfide reductase, subunit C, putative  28.33 
 
 
304 aa  53.1  0.000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.292161  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4045  polysulfide reductase, subunit C  25.47 
 
 
313 aa  52.4  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2564  polysulphide reductase, NrfD  26.54 
 
 
331 aa  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.564055  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0509  polysulphide reductase, NrfD  27.14 
 
 
314 aa  50.8  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1207  Polysulphide reductase NrfD  25.79 
 
 
305 aa  50.4  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2402  Polysulphide reductase NrfD  28.38 
 
 
331 aa  49.7  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000296698  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1337  Polysulphide reductase NrfD  24.36 
 
 
304 aa  48.9  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.794344  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1464  polysulphide reductase NrfD  26.56 
 
 
347 aa  46.6  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3442  polysulphide reductase, NrfD  27.72 
 
 
314 aa  46.2  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0952  polysulfide reductase, subunit C, putative  26.25 
 
 
304 aa  44.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.18668  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4225  Polysulphide reductase NrfD  27.45 
 
 
389 aa  43.1  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000782128  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02723  hypothetical protein  24.38 
 
 
323 aa  42.7  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>