12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_0197 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_0197  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  551  1e-156  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.331771  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0197  hypothetical protein  99.28 
 
 		 277 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0255  hypothetical protein  47.81 
 
 		 296 aa  249  3e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2714  hypothetical protein  47.31 
 
 		 251 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.572557  hitchhiker  0.0000684426 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0795  hypothetical protein  45.85 
 
 		 250 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0304356  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3430  hypothetical protein  42.7 
 
 		 253 aa  194  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3123  hypothetical protein  40.29 
 
 		 249 aa  185  5e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3955  hypothetical protein  35.5 
 
 		 338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3587  hypothetical protein  36.08 
 
 		 317 aa  160  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0298  hypothetical protein  33.44 
 
 		 321 aa  139  7e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0945174  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03976  outer membrane protein, porin family  28.57 
 
 		 184 aa  47  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0813  porin family outer membrane protein  28.44 
 
 		 101 aa  46.6  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>