22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1008 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1008  cell division protein ZipA  100 
 
 
170 aa  357  5e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3355  cell division protein ZipA  98.24 
 
 
172 aa  350  4e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0986  cell division protein ZipA  98.24 
 
 
172 aa  350  5e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1020  cell division protein ZipA  95.88 
 
 
188 aa  343  5e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.594259  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3271  cell division protein ZipA  63.12 
 
 
184 aa  227  6e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1847  cell division protein ZipA  55.26 
 
 
165 aa  179  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.630805  normal  0.844154 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2771  hypothetical protein  53.55 
 
 
158 aa  173  8e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00380494 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3212  cell division protein ZipA  50.63 
 
 
164 aa  170  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3561  hypothetical protein  45.4 
 
 
185 aa  138  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.248722  normal  0.0187655 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1747  hypothetical protein  44.16 
 
 
177 aa  134  7.000000000000001e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.497705  normal  0.12531 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1420  hypothetical protein  45.45 
 
 
170 aa  132  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1883  hypothetical protein  39.74 
 
 
163 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288724  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1180  hypothetical protein  40.13 
 
 
161 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1531  hypothetical protein  39.61 
 
 
163 aa  120  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.348224  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7516  hypothetical protein  42.76 
 
 
181 aa  118  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3180  hypothetical protein  42.31 
 
 
164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.942907  normal  0.672833 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06028  hypothetical protein  29.14 
 
 
159 aa  61.2  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3317  aminoglycoside phosphotransferase  29.14 
 
 
586 aa  58.2  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.479259  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4301  hypothetical protein  26.35 
 
 
169 aa  57.8  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4505  hypothetical protein  42.53 
 
 
93 aa  54.3  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1431  hypothetical protein  28.48 
 
 
527 aa  45.1  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.882787  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4338  hypothetical protein  24.83 
 
 
717 aa  43.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427391  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>