27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_4416 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_4416  hypothetical protein  100 
 
 
472 aa  967    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.710672  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4275  hypothetical protein  99.78 
 
 
826 aa  951    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2858  hypothetical protein  44.02 
 
 
835 aa  398  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1693  hypothetical protein  38.36 
 
 
830 aa  297  2e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.349675  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1292  hypothetical protein  37.98 
 
 
841 aa  272  8.000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0886595 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3853  hypothetical protein  34.88 
 
 
845 aa  254  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0085  hypothetical protein  34.88 
 
 
849 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0321951  normal  0.899584 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2253  subtilisin-like serine protease  37.01 
 
 
823 aa  251  2e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2676  hypothetical protein  35.62 
 
 
822 aa  251  2e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.70915 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2776  subtilisin-like serine protease  34.69 
 
 
830 aa  238  1e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.278125  normal  0.827378 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4230  hypothetical protein  34.78 
 
 
789 aa  239  1e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.828103  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4253  hypothetical protein  32.38 
 
 
846 aa  235  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.63096  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1074  hypothetical protein  33.12 
 
 
825 aa  219  8.999999999999998e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5328  hypothetical protein  30.79 
 
 
829 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355422  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4804  hypothetical protein  30.75 
 
 
831 aa  211  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0387  Y4bN protein  34.42 
 
 
814 aa  194  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0549817  normal  0.142123 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3864  hypothetical protein  30.26 
 
 
847 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.000004588 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1586  hypothetical protein  30.26 
 
 
847 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4893  hypothetical protein  28.36 
 
 
835 aa  156  9e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3535  hypothetical protein  27.4 
 
 
850 aa  144  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.692569  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2088  hypothetical protein  28.65 
 
 
847 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3670  hypothetical protein  26.82 
 
 
851 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.758768  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5488  hypothetical protein  26.34 
 
 
847 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1641  Subtilisin-like serine protease protein  26 
 
 
570 aa  50.1  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3322  S8A family peptidase  44.64 
 
 
795 aa  50.1  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.546962  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3504  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.86 
 
 
827 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.227841  normal  0.192563 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3542  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.25 
 
 
638 aa  43.1  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0100576  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>