165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1577 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1577  putative efflux pump component MtrF  100 
 
 		 263 aa  522  1e-147  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2308  AbgT transporter family  99.02 
 
 		 508 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950001  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1548  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  99.02 
 
 		 508 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2289  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  99.02 
 
 		 508 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1786  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  99.02 
 
 		 510 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1983  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  99.02 
 
 		 510 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.328307 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01313  predicted cryptic aminobenzoyl-glutamate transporter  98.54 
 
 		 508 aa  397  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1452  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  98.54 
 
 		 508 aa  397  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01323  hypothetical protein  98.54 
 
 		 508 aa  397  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0518  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  80.39 
 
 		 507 aa  340  1e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4202  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  75 
 
 		 508 aa  328  5.0000000000000004e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.609868  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0400  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  79.9 
 
 		 505 aa  315  5e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.703061  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0028  AbgT putative transporter  42.65 
 
 		 512 aa  183  3e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.790153  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0064  AbgT putative transporter  37.69 
 
 		 518 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000877421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0018  AbgT putative transporter  40.99 
 
 		 511 aa  169  4e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0029  AbgT putative transporter  41.12 
 
 		 506 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13432  normal  0.390829 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2500  AbgT putative transporter  42.21 
 
 		 512 aa  163  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.393167  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2550  AbgT putative transporter  42.21 
 
 		 512 aa  163  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2328  efflux pump component MtrF  39.8 
 
 		 516 aa  161  1e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.25696  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21460  putative p-aminobenzoyl-glutamate transporter  37.69 
 
 		 585 aa  155  6e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3673  AbgT putative transporter  36.77 
 
 		 518 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3120  AbgT putative transporter  36.32 
 
 		 520 aa  137  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1352  AbgT putative transporter  35 
 
 		 519 aa  135  5e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000127247  normal  0.0238452 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3449  transporter  36.94 
 
 		 512 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3423  transporter  34.23 
 
 		 515 aa  135  9e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.898769 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1944  AbgT putative transporter  36.76 
 
 		 519 aa  134  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.432903  decreased coverage  0.00626673 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0537  AbgT putative transporter  35.14 
 
 		 529 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.121882  normal  0.78057 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1508  AbgT putative transporter  35.03 
 
 		 523 aa  131  9e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3559  putative efflux pump component MtrF  37.5 
 
 		 535 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3654  AbgT putative transporter  35.5 
 
 		 537 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004283  putative p-aminobenzoyl-glutamate transporter  33.33 
 
 		 519 aa  129  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5237  AbgT putative transporter  32.84 
 
 		 514 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0800  putative efflux pump component MtrF  33.79 
 
 		 509 aa  129  5.0000000000000004e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0739  putative ion transporter  32.88 
 
 		 519 aa  128  7.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2198  AbgT putative transporter  37.5 
 
 		 534 aa  128  8.000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0389  hypothetical protein  34.01 
 
 		 519 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2728  transposase  83.56 
 
 		 137 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0156  AbgT putative transporter  36.5 
 
 		 538 aa  126  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.632237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4830  hypothetical protein  98.28 
 
 		 226 aa  126  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.685032  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00653  putative p-aminobenzoyl-glutamate transport protein (AbgT family)  36.5 
 
 		 525 aa  127  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2047  transposase  98.31 
 
 		 78 aa  127  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1571  transposase  88.06 
 
 		 70 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0167  AbgT putative transporter  33.33 
 
 		 520 aa  125  5e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.583779  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4688  transposase  98.28 
 
 		 71 aa  125  5e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.980351  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01141  hypothetical protein  31.96 
 
 		 519 aa  125  6e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3745  putative IS1 encoded protein  92.19 
 
 		 75 aa  125  6e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0513  putative IS1 encoded protein  91.04 
 
 		 92 aa  125  7e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4826  transposase  81.94 
 
 		 77 aa  125  7e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.821956  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3988  AbgT putative transporter  37.5 
 
 		 532 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.025023  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3878  putative IS1 encoded protein  93.75 
 
 		 68 aa  125  8.000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4057  AbgT putative transporter  35.5 
 
 		 539 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.106368  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4610  putative IS1 encoded protein  83.56 
 
 		 76 aa  125  8.000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0652  glycosy hydrolase, family 38  98.31 
 
 		 416 aa  125  9e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.216278  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0151  AbgT putative transporter  32.64 
 
 		 519 aa  124  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0146  AbgT putative transporter  32.64 
 
 		 519 aa  124  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0134  AbgT putative transporter  35.5 
 
 		 538 aa  125  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.722786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1388  putative ion transporter  38.32 
 
 		 530 aa  124  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.158074  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0331  hypothetical protein  70.45 
 
 		 93 aa  124  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.136864  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4871  putative IS1 encoded protein  82.19 
 
 		 74 aa  124  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.648784  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0819  galactose binding protein  84.29 
 
 		 137 aa  124  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1330  putative IS1 encoded protein  98.28 
 
 		 74 aa  124  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0010619  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1337  putative IS1 encoded protein  93.55 
 
 		 90 aa  124  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000127234  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1512  transposase  100 
 
 		 59 aa  124  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000622472  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0146  AbgT putative transporter  32.64 
 
 		 519 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3814  transposase  93.65 
 
 		 74 aa  124  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.988476  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0021  transposase  95.16 
 
 		 62 aa  124  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000472471  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4112  transposase  95.16 
 
 		 62 aa  124  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1408  transposase  98.28 
 
 		 79 aa  124  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0590912  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0267  hypothetical protein  85.51 
 
 		 91 aa  124  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3141  transposase  92.19 
 
 		 74 aa  123  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0147  AbgT putative transporter  32.41 
 
 		 519 aa  123  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3227  transposase  98.31 
 
 		 90 aa  123  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0561  putative IS1 encoded protein  96.67 
 
 		 74 aa  123  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000545935  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1693  putative IS1 encoded protein  96.61 
 
 		 75 aa  123  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.100033  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0204  transposase  95 
 
 		 96 aa  123  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1659  transposase  92.19 
 
 		 68 aa  123  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3981  putative IS1 encoded protein  79.75 
 
 		 85 aa  123  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20354  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2879  putative IS1 encoded protein  98.28 
 
 		 96 aa  123  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.274258  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3968  putative IS1 encoded protein  95 
 
 		 74 aa  122  5e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4001  transposase  98.31 
 
 		 63 aa  122  5e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.828259  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4549  transposase  93.75 
 
 		 67 aa  122  5e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4021  putative IS1 encoded protein  85.71 
 
 		 73 aa  122  5e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2992  putative IS1 encoded protein  98.28 
 
 		 76 aa  122  5e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0150403  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0637  transposase  98.31 
 
 		 60 aa  122  6e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.797915  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4510  ankyrin-repeat protein A  98.28 
 
 		 141 aa  122  6e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3247  transposase  98.28 
 
 		 82 aa  122  6e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.31729  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3963  transposase  84.29 
 
 		 70 aa  122  7e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0213  transposase  86.96 
 
 		 71 aa  122  7e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1500  putative IS1 encoded protein  98.28 
 
 		 97 aa  122  7e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2011  putative IS1 encoded protein  92.06 
 
 		 82 aa  122  8e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2091  putative IS1 encoded protein  98.28 
 
 		 68 aa  122  8e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000323607  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3237  putative IS1 encoded protein  83.33 
 
 		 102 aa  121  9e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0222  transposase  95 
 
 		 64 aa  122  9e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0750  transposase  98.28 
 
 		 68 aa  121  9e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1320  putative IS1 encoded protein  98.28 
 
 		 84 aa  121  9e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.640371  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3494  putative IS1 encoded protein  95 
 
 		 78 aa  121  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.750658  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0404  hypothetical protein  33.33 
 
 		 534 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000189157  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4787  transposase  98.28 
 
 		 65 aa  121  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2682  transposase  93.55 
 
 		 62 aa  121  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.103388  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3101  putative IS1 encoded protein  98.28 
 
 		 81 aa  121  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000424712  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>