14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3746 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009427  Saro_3746  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  364  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3328  hypothetical protein  66.43 
 
 
167 aa  202  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.311727  hitchhiker  0.00221745 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5489  hypothetical protein  39.61 
 
 
159 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1518  hypothetical protein  37.5 
 
 
155 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1012  Polyketide cyclase/dehydrase  31.25 
 
 
147 aa  70.5  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4528  hypothetical protein  25.35 
 
 
156 aa  53.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0311362 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3537  Polyketide cyclase/dehydrase  25.69 
 
 
152 aa  50.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.642058  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4582  hypothetical protein  28.92 
 
 
174 aa  45.8  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.165656 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1166  Polyketide cyclase/dehydrase  26.03 
 
 
148 aa  44.3  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0805465  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2609  hypothetical protein  24.48 
 
 
162 aa  43.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0546074  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4393  hypothetical protein  52.63 
 
 
151 aa  43.5  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00463906  normal  0.793134 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0193  hypothetical protein  21.14 
 
 
162 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5038  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.37 
 
 
150 aa  40.8  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.119681 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1265  Polyketide cyclase/dehydrase  23.65 
 
 
149 aa  41.2  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0100939 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>