30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3244 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_3244  HPr kinase  100 
 
 
286 aa  581  1.0000000000000001e-165  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3276  HPr kinase  28.63 
 
 
316 aa  97.1  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0966  hypothetical protein  37.14 
 
 
317 aa  82  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3385  HPr kinase  25.39 
 
 
324 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.448245  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1478  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  42.31 
 
 
330 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1280  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  38.89 
 
 
323 aa  72.8  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0056  HPr kinase  28.14 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2339  HPr kinase  26.47 
 
 
325 aa  69.3  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0970084 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4906  HPr kinase  24.06 
 
 
298 aa  66.2  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0668062  normal  0.137945 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3026  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  26.8 
 
 
340 aa  61.6  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1025  HPr kinase  36.26 
 
 
322 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.205108 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4549  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  30.66 
 
 
323 aa  58.9  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.123281 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1352  hypothetical protein  27.68 
 
 
268 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2007  HPr kinase  29.27 
 
 
301 aa  55.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.618499 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0820  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  32.06 
 
 
301 aa  55.5  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2954  HPr kinase  29.91 
 
 
329 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.134566  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1464  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  27.4 
 
 
300 aa  52.4  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1353  hypothetical protein  26.27 
 
 
302 aa  51.2  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2558  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  39.33 
 
 
306 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1964  HPr kinase  39.33 
 
 
307 aa  50.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.447407 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2661  hypothetical protein  30.16 
 
 
296 aa  50.1  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0700919  decreased coverage  0.00119506 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1217  HPr kinase  38.2 
 
 
306 aa  49.3  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0169089  normal  0.100415 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5037  HPr kinase  25.53 
 
 
313 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1592  HPr kinase  24.22 
 
 
330 aa  46.6  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1373  HPr kinase  43.75 
 
 
330 aa  46.6  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.401214  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0853  hypothetical protein  28.93 
 
 
361 aa  45.8  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2830  HPr kinase  33.72 
 
 
325 aa  45.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2549  HPr kinase  27.03 
 
 
303 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0304295 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26991  hypothetical protein  33.63 
 
 
302 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3572  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  40.32 
 
 
288 aa  42.4  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.718731 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>