164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3034 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_3034  hypothetical protein  100 
 
 
226 aa  446  1.0000000000000001e-124  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.671959  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1518  hypothetical protein  29.27 
 
 
328 aa  75.1  0.0000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0223  FHA domain-containing protein  38.12 
 
 
513 aa  69.3  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.443938 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0678  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.27 
 
 
510 aa  67.8  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0623565  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0040  minor extracellular protease epr  28.21 
 
 
297 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0844257 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1928  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.26 
 
 
452 aa  65.5  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2471  hypothetical protein  34.44 
 
 
225 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1185  subtilisin-like serine protease-like  29.11 
 
 
891 aa  64.3  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1379  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.48 
 
 
641 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863708  normal  0.0771449 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4060  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.38 
 
 
627 aa  63.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0156752  normal  0.194218 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17620  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.51 
 
 
595 aa  63.9  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1052  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.68 
 
 
423 aa  63.9  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.223191  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2354  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.77 
 
 
453 aa  63.2  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2303  hypothetical protein  34.25 
 
 
225 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.754435  normal  0.961245 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2220  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.28 
 
 
397 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000312805  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5739  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  29.17 
 
 
298 aa  63.5  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.750481  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2156  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.4 
 
 
401 aa  62.8  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0995  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  35.1 
 
 
398 aa  62.4  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.818961  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1192  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.31 
 
 
417 aa  62  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1050  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.65 
 
 
413 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.141106  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0783  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.72 
 
 
597 aa  60.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2600  subtilisin-like serine protease-like  27.53 
 
 
1315 aa  60.5  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0639979  normal  0.124831 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1707  hypothetical protein  37.8 
 
 
222 aa  60.1  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4314  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.53 
 
 
431 aa  59.7  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.106523 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0758  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.56 
 
 
227 aa  59.7  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3593  subtilisin Carlsberg  28.7 
 
 
298 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2836  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.69 
 
 
440 aa  58.9  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.950559  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05170  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.07 
 
 
653 aa  58.2  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4203  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.54 
 
 
915 aa  58.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0480  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.84 
 
 
431 aa  56.2  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.255354  normal  0.124332 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4754  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.34 
 
 
445 aa  56.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00404816  hitchhiker  0.000540965 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3334  hypothetical protein  31.85 
 
 
464 aa  56.2  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.261998  normal  0.860622 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3564  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.52 
 
 
1060 aa  56.2  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3945  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.51 
 
 
447 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.542591 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0664  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.5 
 
 
689 aa  55.8  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38238  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0527  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.5 
 
 
688 aa  55.8  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.841411  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4101  minor extracellular protease  31.21 
 
 
917 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0365  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.32 
 
 
487 aa  55.8  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.07 
 
 
797 aa  55.5  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0488  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.65 
 
 
577 aa  55.5  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.718847  normal  0.491604 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2196  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.39 
 
 
601 aa  55.5  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.327991 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4488  minor extracellular protease VpR  31.21 
 
 
917 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4475  minor extracellular protease VpR  31.85 
 
 
917 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0393  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.58 
 
 
660 aa  54.3  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.13824 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0552  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.49 
 
 
490 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4252  minor extracellular protease VpR  31.21 
 
 
917 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4226  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.21 
 
 
1454 aa  53.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.542738  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0265  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  22.22 
 
 
320 aa  53.9  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0291  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  22.22 
 
 
320 aa  53.5  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4584  minor extracellular protease VpR  31.21 
 
 
917 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0761  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  34.72 
 
 
483 aa  53.9  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0241492 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1099  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  23.98 
 
 
495 aa  54.3  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0536343  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2143  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.19 
 
 
370 aa  53.9  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0298  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  22.22 
 
 
320 aa  53.9  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000146885  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0761  minor extracellular protease VpR  31.21 
 
 
917 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00881527  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4090  minor extracellular protease  31.21 
 
 
917 aa  53.5  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.957358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4436  minor extracellular protease VpR  31.21 
 
 
917 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0862  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.05 
 
 
557 aa  53.5  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0535197  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2052  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.76 
 
 
540 aa  53.1  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2216  alkaline serine protease  29.11 
 
 
397 aa  53.1  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00115327  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2155  alkaline serine protease  29.11 
 
 
397 aa  53.1  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.130046  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2139  alkaline serine protease  29.11 
 
 
397 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2380  alkaline serine protease  29.11 
 
 
397 aa  53.1  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2398  alkaline serine protease, subtilase family  29.11 
 
 
397 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0119  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.3 
 
 
587 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.165742 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0617  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.48 
 
 
463 aa  52.4  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.230581  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2980  alkaline serine protease, subtilase family  29.75 
 
 
397 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.503855 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4209  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  31.1 
 
 
1618 aa  52.4  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3892  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.55 
 
 
295 aa  52.4  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000195035  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1188  FHA domain-containing protein  33.33 
 
 
541 aa  52.8  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00110568  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2480  alkaline serine protease, subtilase family  29.75 
 
 
397 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2345  alkaline serine protease, subtilase family  29.75 
 
 
397 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2075  subtilisin  26.71 
 
 
485 aa  52.4  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.734666  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2410  alkaline serine protease  29.75 
 
 
397 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.329944  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3716  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.11 
 
 
524 aa  52.4  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.338967 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0682  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  32.5 
 
 
349 aa  52  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520693  normal  0.10054 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0471  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.16 
 
 
433 aa  51.6  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0717859 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4437  minor extracellular protease VpR  30.57 
 
 
917 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1437  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.38 
 
 
425 aa  51.6  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.948372  normal  0.0800108 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3756  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.82 
 
 
601 aa  51.6  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.652103  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2027  aerolysin  26.09 
 
 
399 aa  50.8  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0950  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.35 
 
 
517 aa  50.8  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.943856  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3447  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.33 
 
 
396 aa  50.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4440  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.71 
 
 
398 aa  50.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.223031  hitchhiker  0.00412922 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0755  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.99 
 
 
679 aa  50.4  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.312676  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2949  hypothetical protein  29.47 
 
 
225 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111575  normal  0.39861 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0221  subtilisin-like serine protease  32.32 
 
 
416 aa  49.7  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0364  subtilisin-like serine protease-like  29.07 
 
 
692 aa  49.7  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.75506  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2643  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.48 
 
 
462 aa  50.1  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3542  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.93 
 
 
638 aa  50.1  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0100576  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0791  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.13 
 
 
835 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1681  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.38 
 
 
444 aa  49.7  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.280538  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0938  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.83 
 
 
412 aa  49.7  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.980042 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3754  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.86 
 
 
1153 aa  49.3  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.338541 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3323  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.9 
 
 
339 aa  48.9  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3123  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.78 
 
 
640 aa  48.9  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00188421  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2188  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.11 
 
 
415 aa  48.9  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.180724  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0162  subtilisin-like serine proteases-like  27.33 
 
 
576 aa  48.9  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3265  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.19 
 
 
583 aa  48.9  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536074  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40456  predicted protein  27.04 
 
 
834 aa  48.5  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>