More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0950 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_0950  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  100 
 
 
517 aa  1040    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.943856  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2339  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  32.11 
 
 
672 aa  144  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.206691  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5739  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  36.3 
 
 
298 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.750481  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3593  subtilisin Carlsberg  35.93 
 
 
298 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1249  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  32.21 
 
 
431 aa  108  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.613624  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1928  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.8 
 
 
452 aa  104  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0931  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33 
 
 
500 aa  103  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143808  normal 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0040  minor extracellular protease epr  33.47 
 
 
297 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0844257 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2480  alkaline serine protease, subtilase family  32.14 
 
 
397 aa  101  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2980  alkaline serine protease, subtilase family  32.14 
 
 
397 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.503855 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2345  alkaline serine protease, subtilase family  32.14 
 
 
397 aa  97.8  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2410  alkaline serine protease  31.35 
 
 
397 aa  97.8  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.329944  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2354  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.93 
 
 
453 aa  96.7  8e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2220  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.42 
 
 
397 aa  96.7  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000312805  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2143  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.25 
 
 
370 aa  96.3  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.05 
 
 
699 aa  96.3  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2027  aerolysin  34.51 
 
 
399 aa  95.5  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2052  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.47 
 
 
540 aa  95.9  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2216  alkaline serine protease  31.62 
 
 
397 aa  94.7  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00115327  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2155  alkaline serine protease  31.62 
 
 
397 aa  94.7  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.130046  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2139  alkaline serine protease  31.75 
 
 
397 aa  94.7  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478532  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2398  alkaline serine protease, subtilase family  31.62 
 
 
397 aa  94.7  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2380  alkaline serine protease  31.62 
 
 
397 aa  94.7  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1874  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  32.02 
 
 
474 aa  93.6  8e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2280  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.71 
 
 
399 aa  93.6  9e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2671  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  33.58 
 
 
479 aa  93.2  9e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4101  minor extracellular protease  39.64 
 
 
917 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4488  minor extracellular protease VpR  39.64 
 
 
917 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2075  subtilisin  32.63 
 
 
485 aa  92  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.734666  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3522  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.74 
 
 
615 aa  92  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3055  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.44 
 
 
483 aa  91.3  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.154731  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4437  minor extracellular protease VpR  31.34 
 
 
917 aa  91.3  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4203  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.18 
 
 
915 aa  91.3  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0761  minor extracellular protease VpR  35.68 
 
 
917 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00881527  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03458  cold-active serine alkaline protease  30.5 
 
 
533 aa  89.4  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0416206  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4109  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.12 
 
 
520 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.941558 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0365  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.14 
 
 
487 aa  88.6  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4090  minor extracellular protease  37.89 
 
 
917 aa  88.2  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.957358  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0715  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  32.49 
 
 
541 aa  88.6  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4436  minor extracellular protease VpR  37.8 
 
 
917 aa  88.6  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4252  minor extracellular protease VpR  38.41 
 
 
917 aa  87.4  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4584  minor extracellular protease VpR  38.41 
 
 
917 aa  87.4  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0364  subtilisin-like serine protease-like  29.43 
 
 
692 aa  87  7e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.75506  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2836  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.03 
 
 
440 aa  87  8e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.950559  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1805  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.67 
 
 
396 aa  87  8e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0411901  normal  0.0459712 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1827  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.33 
 
 
1054 aa  86.7  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.426628  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1099  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  29.48 
 
 
495 aa  85.9  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0536343  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2003  intracellular serine protease  29.45 
 
 
315 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2035  intracellular serine protease  29.35 
 
 
316 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2923000000000002e-27 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17620  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.21 
 
 
595 aa  85.5  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2098  intracellular serine protease  28.8 
 
 
316 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00047952  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0795  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  31.23 
 
 
442 aa  85.5  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.746583  normal  0.457472 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3306  intracellular serine protease  29.45 
 
 
315 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00151465 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4475  minor extracellular protease VpR  34.42 
 
 
917 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4085  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  31.97 
 
 
615 aa  84.7  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.99 
 
 
797 aa  84.7  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2735  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.91 
 
 
669 aa  84.3  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.637714 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1456  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.87 
 
 
406 aa  84.7  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.173493  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2078  intracellular serine protease  28.48 
 
 
316 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0118694  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0861  intracellular serine protease  27.84 
 
 
307 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000163196  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4060  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.71 
 
 
627 aa  84  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0156752  normal  0.194218 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1770  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.63 
 
 
527 aa  84  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1859  intracellular serine protease  28.8 
 
 
316 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.749891  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1813  intracellular serine protease  28.8 
 
 
316 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2001  intracellular serine protease  28.8 
 
 
316 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2056  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.44 
 
 
392 aa  83.6  0.000000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.317337  normal  0.564481 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1829  intracellular serine protease  29.03 
 
 
316 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1096  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.12 
 
 
589 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1710  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.19 
 
 
396 aa  82.8  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1125  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.12 
 
 
589 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.798248  normal  0.349528 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3301  putative serine protease  33.45 
 
 
407 aa  83.2  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.44867 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1388  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.25 
 
 
444 aa  82.4  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.196735  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1319  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.97 
 
 
465 aa  82.4  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8803  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.89 
 
 
464 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.453986  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1864  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.48 
 
 
316 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0393  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.12 
 
 
660 aa  81.3  0.00000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.13824 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3122  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.92 
 
 
1205 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.950129  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0058  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.23 
 
 
449 aa  80.5  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  29.39 
 
 
644 aa  80.1  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4226  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.42 
 
 
1454 aa  80.1  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.542738  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1611  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.96 
 
 
402 aa  79.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.669489  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2871  cold-active alkaline serine protease  30.43 
 
 
789 aa  79  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2600  subtilisin-like serine protease-like  32.34 
 
 
1315 aa  79  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0639979  normal  0.124831 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1195  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.53 
 
 
482 aa  79  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2196  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.64 
 
 
601 aa  79  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.327991 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0357  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.54 
 
 
577 aa  79  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0119  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.07 
 
 
587 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.165742 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0862  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.71 
 
 
557 aa  79  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0535197  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2188  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.42 
 
 
415 aa  78.6  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.180724  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3892  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.86 
 
 
295 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000195035  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0437  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.72 
 
 
517 aa  78.2  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00000329781  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2196  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.71 
 
 
423 aa  77.8  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0480  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.72 
 
 
431 aa  77.8  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.255354  normal  0.124332 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0783  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.3 
 
 
597 aa  77  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05170  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.58 
 
 
653 aa  77  0.0000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1628  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.93 
 
 
1215 aa  76.6  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.279329 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3207  hypothetical protein  30.74 
 
 
435 aa  76.3  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000789667 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22270  subtilisin-like serine protease  29.34 
 
 
405 aa  76.3  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0324587  normal  0.352098 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3123  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.65 
 
 
640 aa  76.6  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00188421  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1513  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.24 
 
 
325 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>