65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2303 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2303  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.754435  normal  0.961245 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2471  hypothetical protein  88.39 
 
 		 225 aa  397  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2949  hypothetical protein  73.76 
 
 		 225 aa  318  3e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111575  normal  0.39861 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0758  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  47.09 
 
 		 227 aa  148  6e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1707  hypothetical protein  40.62 
 
 		 222 aa  119  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2971  hypothetical protein  38.5 
 
 		 222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0357  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.91 
 
 		 577 aa  68.9  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3034  hypothetical protein  34.25 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.671959  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1052  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.65 
 
 		 423 aa  61.6  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.223191  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1593  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.1 
 
 		 396 aa  60.8  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3892  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.58 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000195035  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2354  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.13 
 
 		 453 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0527  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.13 
 
 		 688 aa  57  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.841411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1192  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.63 
 
 		 417 aa  55.5  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1827  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.33 
 
 		 1054 aa  55.1  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.426628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1518  hypothetical protein  21.36 
 
 		 328 aa  54.7  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1050  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.14 
 
 		 413 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.141106  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2027  aerolysin  25 
 
 		 399 aa  51.6  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8518  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.29 
 
 		 400 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.964571  normal  0.0186801 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1928  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.8 
 
 		 452 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0664  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.02 
 
 		 689 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38238  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4085  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  26.92 
 
 		 615 aa  49.7  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1099  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  25.22 
 
 		 495 aa  49.7  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0536343  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5496  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.93 
 
 		 635 aa  49.3  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.252703 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0265  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  22.22 
 
 		 320 aa  49.3  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0298  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  22.22 
 
 		 320 aa  48.9  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000146885  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1683  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.94 
 
 		 559 aa  48.5  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0162  subtilisin-like serine proteases-like  24.68 
 
 		 576 aa  48.1  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2735  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.02 
 
 		 669 aa  48.1  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.637714 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0783  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.08 
 
 		 597 aa  48.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3593  subtilisin Carlsberg  26.28 
 
 		 298 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0714  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  29.03 
 
 		 683 aa  47  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0950  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.2 
 
 		 517 aa  47.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.943856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7060  hypothetical protein  27.31 
 
 		 350 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.756131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4267  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.18 
 
 		 429 aa  46.6  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.447116 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0365  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.42 
 
 		 487 aa  46.2  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5739  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  25.64 
 
 		 298 aa  45.8  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.750481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.66 
 
 		 797 aa  46.2  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2143  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.77 
 
 		 370 aa  45.8  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0291  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  21.67 
 
 		 320 aa  45.8  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0089  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.84 
 
 		 368 aa  45.4  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0862  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.5 
 
 		 557 aa  45.4  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0535197  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2052  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.56 
 
 		 540 aa  45.4  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4314  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.09 
 
 		 431 aa  45.4  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.106523 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0299  hypothetical protein  41.79 
 
 		 577 aa  45.1  0.0009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348055 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2003  intracellular serine protease  27.61 
 
 		 315 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2196  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.16 
 
 		 601 aa  44.3  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.327991 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3207  hypothetical protein  26.18 
 
 		 435 aa  45.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000789667 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3440  hypothetical protein  26.18 
 
 		 435 aa  45.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.859168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8473  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.68 
 
 		 417 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0364  subtilisin-like serine protease-like  26.47 
 
 		 692 aa  44.3  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.75506  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2836  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.82 
 
 		 440 aa  43.9  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.950559  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1864  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.86 
 
 		 316 aa  43.5  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0715  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  29.52 
 
 		 541 aa  43.5  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2035  intracellular serine protease  29.25 
 
 		 316 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2923000000000002e-27 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3306  intracellular serine protease  29.86 
 
 		 315 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151465 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2583  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.92 
 
 		 450 aa  42.7  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00536309  normal  0.0160345 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1829  intracellular serine protease  29.25 
 
 		 316 aa  43.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2075  subtilisin  22.81 
 
 		 485 aa  42.4  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.734666  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2078  intracellular serine protease  29.25 
 
 		 316 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0118694  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2098  intracellular serine protease  27.81 
 
 		 316 aa  42  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00047952  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2001  intracellular serine protease  29.25 
 
 		 316 aa  42  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1813  intracellular serine protease  29.25 
 
 		 316 aa  42  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1859  intracellular serine protease  29.25 
 
 		 316 aa  42  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.749891  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3522  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.06 
 
 		 615 aa  41.6  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>