More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1339 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1339  acyl carrier protein  100 
 
 		 78 aa  150  7e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0280  acyl carrier protein  89.74 
 
 		 78 aa  136  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  88.46 
 
 		 78 aa  135  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1767  acyl carrier protein  86.67 
 
 		 78 aa  127  5.0000000000000004e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300385  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3198  acyl carrier protein  82.05 
 
 		 78 aa  126  9.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2785  acyl carrier protein  82.05 
 
 		 78 aa  126  9.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0459  acyl carrier protein  86.67 
 
 		 78 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997029  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0464  acyl carrier protein  86.67 
 
 		 78 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0572  acyl carrier protein  86.67 
 
 		 78 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000726263  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1052  acyl carrier protein  84 
 
 		 77 aa  123  9e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.784582  normal  0.0871909 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3358  acyl carrier protein  82.89 
 
 		 79 aa  122  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.304425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1070  acyl carrier protein  82.67 
 
 		 77 aa  121  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0381067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2463  acyl carrier protein  82.67 
 
 		 77 aa  121  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0417  acyl carrier protein  84.21 
 
 		 77 aa  121  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1125  acyl carrier protein  82.67 
 
 		 77 aa  121  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.854343  normal  0.264309 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0498  acyl carrier protein  80 
 
 		 78 aa  120  5e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0493  acyl carrier protein  76.92 
 
 		 78 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0529  acyl carrier protein  76.92 
 
 		 78 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.221714 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0558  acyl carrier protein  76.92 
 
 		 78 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1898  acyl carrier protein  75.64 
 
 		 79 aa  118  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281225 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1768  acyl carrier protein  82.19 
 
 		 77 aa  118  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1530  acyl carrier protein  76.92 
 
 		 78 aa  117  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.129893  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3407  acyl carrier protein  78.21 
 
 		 79 aa  117  3.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1058  acyl carrier protein  75.64 
 
 		 78 aa  117  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0713713 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1201  acyl carrier protein  75.64 
 
 		 78 aa  117  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.576937  hitchhiker  0.00368899 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2181  acyl carrier protein  80 
 
 		 77 aa  117  7e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3132  acyl carrier protein  77.63 
 
 		 78 aa  115  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0746  acyl carrier protein  74.36 
 
 		 78 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.746533  normal  0.50277 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  76.92 
 
 		 79 aa  115  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1873  acyl carrier protein  75 
 
 		 78 aa  113  6.9999999999999995e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0107725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1687  acyl carrier protein  75 
 
 		 79 aa  113  7.999999999999999e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2978  acyl carrier protein  75 
 
 		 79 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.702686  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2352  acyl carrier protein  75 
 
 		 79 aa  113  7.999999999999999e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3483  acyl carrier protein  75 
 
 		 79 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.057924  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3819  acyl carrier protein  75 
 
 		 79 aa  113  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.542696  normal  0.0672791 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2468  acyl carrier protein  75 
 
 		 79 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2301  acyl carrier protein  75 
 
 		 79 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0385608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2298  acyl carrier protein  76.71 
 
 		 106 aa  112  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1216  acyl carrier protein  74.36 
 
 		 78 aa  112  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729885  normal  0.686684 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1627  acyl carrier protein  75.32 
 
 		 77 aa  111  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0810267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0894  acyl carrier protein  73.33 
 
 		 79 aa  110  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0694526 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2519  acyl carrier protein  71.79 
 
 		 79 aa  110  8.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  71.62 
 
 		 78 aa  103  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0713  acyl carrier protein  69.74 
 
 		 78 aa  103  8e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000031745  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1584  acyl carrier protein  71.23 
 
 		 82 aa  102  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34262  normal  0.0373148 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1909  acyl carrier protein  71.23 
 
 		 82 aa  102  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.045523  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1664  Acyl carrier protein (ACP)  66.67 
 
 		 78 aa  102  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0513886  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0685  acyl carrier protein  70.42 
 
 		 75 aa  102  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00698969  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0605  acyl carrier protein  66.67 
 
 		 84 aa  101  4e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  9.329130000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1672  acyl carrier protein  66.67 
 
 		 77 aa  100  6e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1526  acyl carrier protein  65.38 
 
 		 78 aa  100  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.262214 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5148  acyl carrier protein  65.38 
 
 		 79 aa  100  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.166001 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1923  acyl carrier protein  68.83 
 
 		 79 aa  100  7e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000792988  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1232  acyl carrier protein  68.42 
 
 		 79 aa  100  7e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152652  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1580  acyl carrier protein  66.67 
 
 		 84 aa  100  8e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000805484  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1420  acyl carrier protein  65.38 
 
 		 79 aa  100  8e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.704183 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1630  acyl carrier protein  67.11 
 
 		 78 aa  100  9e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000123369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1745  acyl carrier protein  69.74 
 
 		 77 aa  100  9e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000920991  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0798  acyl carrier protein  72.46 
 
 		 77 aa  99.4  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  63.16 
 
 		 78 aa  99.8  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1491  acyl carrier protein  65.38 
 
 		 78 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2121  acyl carrier protein  64.94 
 
 		 79 aa  99.8  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000862864  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1834  acyl carrier protein  67.57 
 
 		 79 aa  99.4  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0103322  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1258  acyl carrier protein  67.11 
 
 		 79 aa  99.4  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2000  acyl carrier protein  71.23 
 
 		 76 aa  98.2  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1935  acyl carrier protein  67.11 
 
 		 77 aa  98.2  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000441044  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1319  acyl carrier protein  63.64 
 
 		 78 aa  97.8  4e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.346066  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4192  acyl carrier protein  64.47 
 
 		 78 aa  97.8  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.666871  normal  0.675617 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1392  acyl carrier protein  62.34 
 
 		 79 aa  97.8  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1351  acyl carrier protein  63.16 
 
 		 82 aa  97.8  5e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1347  acyl carrier protein  63.16 
 
 		 82 aa  97.8  5e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1316  acyl carrier protein  71.01 
 
 		 77 aa  97.8  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1291  acyl carrier protein  71.01 
 
 		 77 aa  97.8  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0873  acyl carrier protein  69.86 
 
 		 79 aa  97.4  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14930  acyl carrier protein  66.22 
 
 		 78 aa  97.4  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1615  acyl carrier protein  64.94 
 
 		 77 aa  97.4  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.161415  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0168  acyl carrier protein  68.06 
 
 		 76 aa  97.4  6e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122767  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2071  acyl carrier protein  68.06 
 
 		 74 aa  97.1  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1979  acyl carrier protein  63.64 
 
 		 77 aa  97.1  8e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485272  decreased coverage  0.000456446 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1090  acyl carrier protein  63.16 
 
 		 77 aa  97.1  8e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.343466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  62.03 
 
 		 80 aa  96.7  9e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2807  acyl carrier protein  63.64 
 
 		 78 aa  96.7  9e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000875833  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2502  acyl carrier protein  63.64 
 
 		 78 aa  96.7  9e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000398484  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2572  acyl carrier protein  63.64 
 
 		 77 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000656295  hitchhiker  0.00274043 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1186  acyl carrier protein  62.34 
 
 		 79 aa  96.3  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.026536 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3071  acyl carrier protein  68.06 
 
 		 79 aa  96.3  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1687  acyl carrier protein  63.64 
 
 		 78 aa  96.3  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000299329  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3498  acyl carrier protein  63.64 
 
 		 78 aa  96.3  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000503689  hitchhiker  0.00947262 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2623  acyl carrier protein  62.34 
 
 		 77 aa  96.3  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000188634  unclonable  0.0000000000890491 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1583  acyl carrier protein  63.64 
 
 		 77 aa  96.3  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000266609  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1579  acyl carrier protein  63.64 
 
 		 78 aa  96.3  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.86341e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2630  acyl carrier protein  62.34 
 
 		 79 aa  96.3  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1733  acyl carrier protein  63.64 
 
 		 79 aa  96.7  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.9219  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02710  acyl carrier protein  67.12 
 
 		 79 aa  96.3  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.312215  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0933  acyl carrier protein  64.79 
 
 		 74 aa  96.7  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000201436  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2395  acyl carrier protein  63.64 
 
 		 77 aa  96.3  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000802043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2465  acyl carrier protein  63.64 
 
 		 77 aa  96.3  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000179854  hitchhiker  0.00129052 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1500  acyl carrier protein  62.34 
 
 		 77 aa  96.3  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000077006  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25670  acyl carrier protein  67.12 
 
 		 78 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000226432  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3277  acyl carrier protein  62.34 
 
 		 79 aa  96.3  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.796037  normal  0.660207 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>