25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_5003 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_5003  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  100 
 
 		 238 aa  458  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000296609 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4489  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  89.08 
 
 		 242 aa  388  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.209705 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6391  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  53.54 
 
 		 235 aa  221  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4168  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39 
 
 		 243 aa  151  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.866648  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0888  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.06 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0994  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.27 
 
 		 261 aa  54.7  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611654 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4444  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.26 
 
 		 312 aa  53.9  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.479767 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1376  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 		 315 aa  50.1  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0099  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.49 
 
 		 318 aa  48.1  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0100  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.4 
 
 		 361 aa  46.6  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1194  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.48 
 
 		 311 aa  46.6  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1816  membrane protein  43.94 
 
 		 257 aa  45.8  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02850  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.54 
 
 		 242 aa  45.4  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0286  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.02 
 
 		 316 aa  45.4  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2551  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.59 
 
 		 319 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1311  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.12 
 
 		 205 aa  45.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000926866  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0521  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.85 
 
 		 655 aa  44.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00918813 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1823  cytidyltransferase-related domain  35.66 
 
 		 386 aa  44.7  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00000210752  normal  0.03789 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1375  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.52 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000233734  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1126  hypothetical protein  29.12 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0720  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.48 
 
 		 499 aa  42.7  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865799 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4949  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.16 
 
 		 247 aa  42.4  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1626  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.96 
 
 		 236 aa  42  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4099  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  41.07 
 
 		 322 aa  42  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5669  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.65 
 
 		 291 aa  41.6  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.109368 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>