27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3857 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3857  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  295  1e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3478  hypothetical protein  78.15 
 
 
156 aa  214  2.9999999999999998e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.603681  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0018  hypothetical protein  53.91 
 
 
154 aa  134  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.073106 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0734  hypothetical protein  54.47 
 
 
167 aa  130  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116764  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0752  hypothetical protein  52.17 
 
 
154 aa  127  8.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00734752 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1697  hypothetical protein  50 
 
 
155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00655824 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3201  TonB-dependent siderophore receptor  48.55 
 
 
154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26950  hypothetical protein  54.92 
 
 
146 aa  124  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.521491 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4139  hypothetical protein  49.14 
 
 
169 aa  120  6e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.374111 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1716  hypothetical protein  47.01 
 
 
153 aa  117  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0951293  normal  0.16109 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0625  hypothetical protein  44.78 
 
 
156 aa  113  7.999999999999999e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4611  hypothetical protein  43.45 
 
 
155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4318  hypothetical protein  42.76 
 
 
155 aa  107  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167531  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4233  hypothetical protein  42.76 
 
 
155 aa  107  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20393  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1893  hypothetical protein  49.61 
 
 
323 aa  106  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1084  hypothetical protein  42.86 
 
 
153 aa  86.3  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.116148  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02310  hypothetical protein  34.81 
 
 
161 aa  80.9  0.000000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1958  hypothetical protein  40.69 
 
 
155 aa  79  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.109021  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1251  hypothetical protein  51.95 
 
 
162 aa  77  0.00000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4766  hypothetical protein  47.86 
 
 
155 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.836196 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4032  hypothetical protein  37.14 
 
 
166 aa  63.9  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.205092 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5367  hypothetical protein  35.96 
 
 
245 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.66384  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4976  hypothetical protein  34.71 
 
 
149 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1470  hypothetical protein  32.17 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1353  hypothetical protein  27.88 
 
 
168 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0838  hypothetical protein  33.88 
 
 
132 aa  41.2  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4185  ammonium transporter  40.74 
 
 
450 aa  40  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.306123 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>