25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0548 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0548  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 363 aa  707    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00949223 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6991  hypothetical protein  41.46 
 
 		 374 aa  216  7e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220253  normal  0.106126 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2703  alkylhydroperoxidase  39.4 
 
 		 360 aa  194  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0582162  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0545  alkylhydroperoxidase  42.73 
 
 		 369 aa  191  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.99267  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5022  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.35 
 
 		 388 aa  179  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.124893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1760  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.34 
 
 		 335 aa  169  7e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4103  hypothetical protein  40.24 
 
 		 342 aa  159  8e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.701404  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0845  alkylhydroperoxidase  29.84 
 
 		 336 aa  140  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.130938  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0293  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.41 
 
 		 336 aa  130  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.193007 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12189  hypothetical protein  31.33 
 
 		 344 aa  110  5e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.25676e-41  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5896  hypothetical protein  31.55 
 
 		 325 aa  57  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.102174 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1869  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.42 
 
 		 201 aa  51.6  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0138584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4300  alkylhydroperoxidase  34.09 
 
 		 144 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.74871 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1433  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.27 
 
 		 212 aa  47.4  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3940  alkylhydroperoxidase  25.9 
 
 		 181 aa  47.4  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.4 
 
 		 176 aa  47  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2768  VCBS  31.71 
 
 		 183 aa  45.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.9777  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0617  hypothetical protein  30.43 
 
 		 190 aa  45.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2566  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  26.83 
 
 		 182 aa  44.3  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144004 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4098  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.95 
 
 		 211 aa  44.3  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7058  alkylhydroperoxidase-like protein  30.36 
 
 		 180 aa  43.5  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.328149  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1265  alkylhydroperoxidase  39.62 
 
 		 101 aa  42.7  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0145354 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1739  hypothetical protein  25 
 
 		 202 aa  42.7  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0852288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8433  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  27.56 
 
 		 227 aa  42.7  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1446  hypothetical protein  31.93 
 
 		 195 aa  42.7  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.885296  normal  0.0846239 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>