39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1114 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1114  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaB  100 
 
 		 687 aa  1380    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1220  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaB  34.56 
 
 		 697 aa  283  8.000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2666  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaB  33.89 
 
 		 716 aa  278  2e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2628  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaB  33.58 
 
 		 741 aa  273  6e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1325  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaB  33.16 
 
 		 769 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2930  PfaB family protein  34.04 
 
 		 760 aa  262  1e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1424  PfaB family protein  33.51 
 
 		 725 aa  260  6e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1452  PfaB family protein  33.38 
 
 		 749 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2734  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaB  33.61 
 
 		 756 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2908  PfaB family protein  30.07 
 
 		 777 aa  252  1e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1418  PfaB family protein  33.02 
 
 		 757 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1422  PfaB family protein  31.44 
 
 		 756 aa  250  8e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2667  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaB  33.55 
 
 		 768 aa  249  2e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2841  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaB  33.17 
 
 		 754 aa  247  4.9999999999999997e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3203  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaB  30.19 
 
 		 765 aa  242  1e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3914  PfaB family protein  27.03 
 
 		 1107 aa  136  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.51111  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1685  polyunsaturated fatty acid synthase PfaB  25.21 
 
 		 854 aa  129  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3103  polyunsaturated fatty acid synthase PfaB  25.12 
 
 		 900 aa  120  9e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.598015  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2593  Beta-ketoacyl synthase  25 
 
 		 1109 aa  117  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5625  polyketide synthase  25.73 
 
 		 2368 aa  108  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4450  PfaB family protein  24.57 
 
 		 917 aa  106  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.562083  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1677  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  26.07 
 
 		 2376 aa  105  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3102  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  27.34 
 
 		 2336 aa  101  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4750  Beta-ketoacyl synthase  23.2 
 
 		 1605 aa  95.5  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.607154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2268  Beta-ketoacyl synthase  27.29 
 
 		 2276 aa  94  8e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2011  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  25.76 
 
 		 2348 aa  87.4  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2104  Beta-ketoacyl synthase  25 
 
 		 2396 aa  84.3  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2114  Beta-ketoacyl synthase  24.6 
 
 		 2391 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3324  Beta-ketoacyl synthase  23.93 
 
 		 2275 aa  79  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4237  Beta-ketoacyl synthase  25.3 
 
 		 2882 aa  63.9  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29560  Type I fatty acid synthase ArsA  23.79 
 
 		 2503 aa  59.3  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2267  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  25.56 
 
 		 2249 aa  53.5  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2105  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  26.46 
 
 		 2477 aa  52.4  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1586  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  22.85 
 
 		 309 aa  49.7  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000106359  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3101  beta-ketoacyl synthase  25.28 
 
 		 2266 aa  47  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  22.22 
 
 		 1337 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3473  Erythronolide synthase  24.56 
 
 		 2314 aa  45.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.715304 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0689  polyketide synthase modules and related proteins-like  21.99 
 
 		 3073 aa  45.4  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000665216 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1962  putative modular PKS system  24.75 
 
 		 1631 aa  44.7  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0314751  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>