15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2595 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2595  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  640    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2515  hypothetical protein  75.74 
 
 		 308 aa  486  1e-136  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.957681 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0468  DNA polymerase beta domain protein region  48.52 
 
 		 304 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.651395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6110  DNA polymerase beta subunit  49.66 
 
 		 303 aa  286  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.425167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4231  nucleotidyltransferase  48.3 
 
 		 302 aa  285  7e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00450243  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3200  hypothetical protein  47.32 
 
 		 301 aa  280  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.853181  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5174  HEPN domain-containing protein  46.41 
 
 		 310 aa  256  4e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0411727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5246  DNA polymerase beta domain protein region  37.29 
 
 		 284 aa  191  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.93784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0837  DNA polymerase beta domain protein region  35.95 
 
 		 286 aa  188  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1720  HEPN domain protein  33.66 
 
 		 305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0261385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3627  hypothetical protein  21.53 
 
 		 545 aa  57.4  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0267777  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0174  hypothetical protein  28.29 
 
 		 161 aa  50.8  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582709  normal  0.551801 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0576  DNA polymerase beta subunit  27.73 
 
 		 121 aa  46.6  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.28507 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4420  DNA polymerase beta subunit  32.43 
 
 		 118 aa  43.5  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478946  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3846  DNA polymerase beta subunit  27.97 
 
 		 121 aa  42.4  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000154582  unclonable  0.00000693944 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>