18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1372 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1372  hypothetical protein  100 
 
 		 338 aa  672    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.119661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3571  hypothetical protein  53.31 
 
 		 337 aa  298  1e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.487226 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0595  hypothetical protein  35.47 
 
 		 370 aa  172  7.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.28067 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0101  hypothetical protein  37.76 
 
 		 366 aa  156  5.0000000000000005e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.867237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0709  hypothetical protein  37.46 
 
 		 372 aa  154  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1212  hypothetical protein  30.59 
 
 		 378 aa  146  5e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2550  hypothetical protein  33.72 
 
 		 372 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0136518 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3101  hypothetical protein  36.26 
 
 		 382 aa  142  9e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.773586  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1539  hypothetical protein  30.48 
 
 		 377 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2498  hypothetical protein  35.84 
 
 		 363 aa  135  8e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2446  hypothetical protein  32.6 
 
 		 364 aa  127  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.011853  normal  0.936007 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1427  hypothetical protein  36.76 
 
 		 367 aa  116  6e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.617063  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01319  hypothetical protein  26.87 
 
 		 361 aa  114  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.436322  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0062  hypothetical protein  29.79 
 
 		 424 aa  61.2  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4324  hypothetical protein  31.93 
 
 		 328 aa  53.1  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.404094  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0087  hypothetical protein  24.81 
 
 		 422 aa  51.2  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113697  unclonable  0.0000108237 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3358  hypothetical protein  22.17 
 
 		 390 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.342415 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1587  hypothetical protein  25.73 
 
 		 355 aa  43.5  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.748272  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>