More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0552 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0552  ABC transporter related  100 
 
 
206 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.110356 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0214  ABC transporter related  64.08 
 
 
202 aa  247  7e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0973  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  57.77 
 
 
365 aa  219  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3483  molybdenum import ATP-binding protein modC  58.82 
 
 
360 aa  209  2e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0702  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  54.85 
 
 
370 aa  208  6e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2720  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  51.71 
 
 
357 aa  203  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.118239  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2880  molybdate transporter ATP-binding protein  51.94 
 
 
352 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2282  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 
367 aa  196  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4171  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  51.96 
 
 
368 aa  195  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00841959  normal  0.195843 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3869  ABC molybdate transporter, ATPase subunit ModC  51.96 
 
 
368 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340875  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2667  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  55.32 
 
 
351 aa  194  6e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0993719  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3880  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  48.08 
 
 
355 aa  192  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.314115  decreased coverage  0.00984217 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1179  molybdate transporter ATP-binding protein  49.27 
 
 
352 aa  192  3e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3662  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  51.46 
 
 
363 aa  191  6e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02320  molybdenum import ATP-binding protein ModC  52.48 
 
 
204 aa  189  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.223411  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1271  molybdate transporter ATP-binding protein  53.3 
 
 
352 aa  189  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4204  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  49.03 
 
 
355 aa  189  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.129707  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3063  molybdate transporter ATP-binding protein  53.26 
 
 
352 aa  188  5e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0060  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  50.98 
 
 
362 aa  187  7e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.400858 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2848  molybdate transporter ATP-binding protein  48.29 
 
 
359 aa  186  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2935  molybdate transporter ATP-binding protein  48.29 
 
 
359 aa  186  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1421  molybdate transporter ATP-binding protein  48.29 
 
 
359 aa  186  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0780  molybdate transporter ATP-binding protein  45.85 
 
 
363 aa  185  3e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.204201  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4252  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  55.17 
 
 
359 aa  185  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0264287  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0090  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  55.17 
 
 
359 aa  185  4e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.508509  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1305  molybdate transporter ATP-binding protein  49.27 
 
 
355 aa  184  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0741  molybdate transporter ATP-binding protein  46.15 
 
 
361 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00590045 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2328  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  55.34 
 
 
367 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3540  molybdate transporter ATP-binding protein  45.63 
 
 
361 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.212575  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0767  molybdate transporter ATP-binding protein  45.67 
 
 
361 aa  181  6e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0821  molybdate transporter ATP-binding protein  45.63 
 
 
361 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000142924 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05727  molybdate transporter ATP-binding protein  45.77 
 
 
368 aa  180  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3197  molybdate transporter ATP-binding protein  45.19 
 
 
361 aa  180  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0432281  hitchhiker  0.0000000546938 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3715  ABC type ATPase  52.15 
 
 
376 aa  179  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3635  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  55.34 
 
 
364 aa  179  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3727  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  50.49 
 
 
367 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2823  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  51.94 
 
 
357 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.623728 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000119  molybdenum transport ATP-binding protein ModC  44.02 
 
 
368 aa  178  4.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.40487  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0828  molybdate transporter ATP-binding protein  46.12 
 
 
361 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.216201  normal  0.647779 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2468  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  55.14 
 
 
354 aa  177  7e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0196749 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0796  molybdate transporter ATP-binding protein  45.15 
 
 
361 aa  177  7e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.19538  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2541  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  49.76 
 
 
372 aa  177  8e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2975  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  49.46 
 
 
362 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0469228  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3918  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  53.88 
 
 
364 aa  175  4e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0653533  normal  0.139289 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4341  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 
374 aa  175  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.884893 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2943  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  48.92 
 
 
359 aa  175  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3865  molybdate transporter ATP-binding protein  44.44 
 
 
361 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2078  molybdenum ABC transporter ATP-binding protein  47.52 
 
 
365 aa  171  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.846917 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2041  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 
356 aa  171  7.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126101  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0663  molybdate transporter ATP-binding protein  49.19 
 
 
366 aa  170  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1518  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 
376 aa  169  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0559044 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2758  ABC transporter:TOBE  45.81 
 
 
362 aa  169  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.394387  normal  0.0551154 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01280  ABC transporter, membrane spanning protein  46.34 
 
 
364 aa  168  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4315  hypothetical protein  48.76 
 
 
362 aa  167  9e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3830  molybdate ABC transporter ATPase  48.9 
 
 
363 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3711  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  51.47 
 
 
358 aa  166  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1940  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  48.9 
 
 
363 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.885935 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1618  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  44.17 
 
 
351 aa  166  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3126  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  49.45 
 
 
364 aa  166  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.97363 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0777  ABC-type transport system, ATPase component  43.14 
 
 
351 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000465044  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5516  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 
358 aa  164  8e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.929695 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3429  molybdenum transporter  48.37 
 
 
361 aa  164  8e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3545  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  48.35 
 
 
363 aa  164  8e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0341777 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40420  molybdenum transport protein ModC  48.37 
 
 
361 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1358  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 
374 aa  164  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2472  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  48.35 
 
 
362 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1285  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  48.35 
 
 
362 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3928  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  55.34 
 
 
364 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2675  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  47.34 
 
 
364 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.586715  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0859  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  46.08 
 
 
377 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.809352  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1457  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  43.27 
 
 
361 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1380  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  48.37 
 
 
356 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.33894  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2847  Fis family transcriptional regulator  44.33 
 
 
362 aa  161  5.0000000000000005e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.801807  normal  0.896227 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03849  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  46.7 
 
 
352 aa  161  5.0000000000000005e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2611  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  42.51 
 
 
351 aa  161  6e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0452  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  40.38 
 
 
351 aa  161  6e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50650  Mo transporter, inner membrane ATP-binding component, ModC1  48.39 
 
 
380 aa  160  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0400965  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0473  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  40.29 
 
 
351 aa  160  2e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2860  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  44.81 
 
 
369 aa  158  5e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.522615  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0452  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  40.78 
 
 
350 aa  158  6e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2026  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  51.06 
 
 
369 aa  158  6e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0538  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  51.08 
 
 
382 aa  158  7e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.39914  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3199  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  45.7 
 
 
363 aa  157  8e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.951869  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2784  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  45.89 
 
 
359 aa  157  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000880352  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1570  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  48.85 
 
 
356 aa  157  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.849947  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2886  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  47.8 
 
 
365 aa  155  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.224709  normal  0.0364702 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3547  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  44.51 
 
 
359 aa  155  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0338  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  46.57 
 
 
221 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.475834 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0433  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  48.31 
 
 
221 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.339672  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5196  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  46.99 
 
 
373 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0415  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  37.38 
 
 
351 aa  154  7e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3446  ABC transporter related  35.58 
 
 
213 aa  154  9e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0514  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  42.31 
 
 
351 aa  153  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0965  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  44.72 
 
 
376 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0847  molybdate transporter ATP-binding protein  51.1 
 
 
352 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.55861  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1183  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  43.98 
 
 
362 aa  152  4e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.286566  hitchhiker  0.00182599 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0186  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  45.32 
 
 
355 aa  151  5e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1256  molybdate transporter ATP-binding protein  45.85 
 
 
352 aa  151  5.9999999999999996e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3321  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  38.65 
 
 
351 aa  151  7e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0878  molybdate transporter ATP-binding protein  50.55 
 
 
352 aa  151  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>