39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0929 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0929  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  100 
 
 
186 aa  352  2e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228436  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0192  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  47.28 
 
 
186 aa  151  5e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00264382  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27940  chemotaxis regulator CheZ  21.23 
 
 
226 aa  50.1  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000139196  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1652  chemotaxis protein CheZ  28.65 
 
 
239 aa  47.4  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00206146  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1759  chemotaxis phosphatase, CheZ  21.56 
 
 
214 aa  45.1  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.414683  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01841  hypothetical protein  21.56 
 
 
214 aa  45.1  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.64287  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1303  chemotaxis regulator CheZ  21.56 
 
 
214 aa  45.1  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238575 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1751  chemotaxis regulator CheZ  21.56 
 
 
214 aa  45.1  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2114  chemotaxis regulator CheZ  21.56 
 
 
214 aa  45.1  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.636511  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1977  chemotaxis regulator CheZ  21.56 
 
 
214 aa  45.1  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1201  chemotaxis phosphatase, CheZ  26.16 
 
 
245 aa  45.1  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0237799  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01852  chemotaxis regulator, protein phosphatase for CheY  21.56 
 
 
214 aa  45.1  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.850509  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2452  chemotaxis regulator CheZ  21.56 
 
 
214 aa  44.7  0.0009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.657615  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3105  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  25.26 
 
 
241 aa  43.9  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.163127  normal  0.170192 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2075  chemotaxis regulator CheZ  22.75 
 
 
214 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000441375 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2130  chemotaxis regulator CheZ  22.75 
 
 
214 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000301905 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2967  chemotaxis regulator CheZ  23.18 
 
 
239 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00162483 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2070  chemotaxis regulator CheZ  23.95 
 
 
214 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492059 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2619  chemotaxis regulator CheZ  21.56 
 
 
214 aa  44.3  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000452679 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2879  hypothetical protein  25.26 
 
 
241 aa  43.9  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1207  chemotaxis regulator CheZ  23.95 
 
 
214 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3047  chemotaxis phosphatase, CheZ  26.32 
 
 
245 aa  43.9  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0783794 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2278  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  25.13 
 
 
245 aa  44.3  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0191817  normal  0.62928 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1330  chemotaxis regulator CheZ  22.75 
 
 
214 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000240713 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3908  chemotaxis phosphatase, CheZ  28.68 
 
 
262 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.925973  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3002  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  26.32 
 
 
241 aa  43.5  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1637  chemotaxis phosphatase, CheZ  26.32 
 
 
245 aa  43.1  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4056  chemotaxis regulator CheZ  23.6 
 
 
222 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4168  chemotaxis regulator CheZ  23.6 
 
 
222 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3521  chemotaxis regulator CheZ  22.16 
 
 
214 aa  42.7  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.328014 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3807  chemotaxis regulator CheZ  23.57 
 
 
236 aa  42.4  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1528  chemotaxis phosphatase, CheZ  28.68 
 
 
262 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.298774  normal  0.476992 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1546  chemotaxis regulator CheZ  25.56 
 
 
214 aa  42  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0126  chemotaxis regulator CheZ  22.78 
 
 
236 aa  42  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1345  chemotaxis phosphatase, CheZ  25.12 
 
 
245 aa  41.6  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1759  chemotaxis regulator CheZ  22.16 
 
 
214 aa  41.6  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1647  chemotaxis regulator CheZ  22.16 
 
 
214 aa  41.6  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0742  chemotaxis regulator CheZ  20.44 
 
 
220 aa  41.2  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.487627  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4339  chemotaxis phosphatase, CheZ  27.94 
 
 
262 aa  41.2  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.297829  normal  0.458128 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>