227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0822 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0822  Highly conserved protein containing a thioredoxin domain  100 
 
 
590 aa  1169    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0928635  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2384  hypothetical protein  33.33 
 
 
705 aa  174  5.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.249366  normal  0.331232 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0588  hypothetical protein  34.54 
 
 
692 aa  172  1e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.155052  normal  0.0633893 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1680  protein of unknown function DUF255  27.13 
 
 
686 aa  171  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0217  protein of unknown function DUF255  28.85 
 
 
517 aa  170  6e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1204  hypothetical protein  32.24 
 
 
661 aa  163  9e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.139299  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0787  hypothetical protein  30.36 
 
 
650 aa  156  1e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.86498  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2274  protein of unknown function DUF255  28 
 
 
552 aa  151  3e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.134722 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0023  protein of unknown function DUF255  34.73 
 
 
643 aa  150  8e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2314  protein of unknown function DUF255  28.38 
 
 
715 aa  147  4.0000000000000006e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2540  hypothetical protein  29.11 
 
 
685 aa  146  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.352542  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1581  protein of unknown function DUF255  23.81 
 
 
544 aa  145  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.397722  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0491  protein of unknown function DUF255  24.93 
 
 
549 aa  145  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1041  hypothetical protein  28.3 
 
 
681 aa  145  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2821  hypothetical protein  28.03 
 
 
569 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.642839  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0261  hypothetical protein  31.12 
 
 
711 aa  139  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2324  hypothetical protein  30.42 
 
 
721 aa  139  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0059  protein of unknown function DUF255  27.95 
 
 
634 aa  138  3.0000000000000003e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0512308  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0787  protein of unknown function DUF255  31.07 
 
 
686 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1072  protein of unknown function DUF255  30.72 
 
 
712 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0898725 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01090  hypothetical protein  33.56 
 
 
681 aa  137  7.000000000000001e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.796364  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0485  protein of unknown function DUF255  25.19 
 
 
680 aa  137  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0471944  normal  0.48167 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0959  protein of unknown function DUF255  31.94 
 
 
686 aa  137  8e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2547  hypothetical protein  27.51 
 
 
684 aa  135  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0291  hypothetical protein  30.03 
 
 
680 aa  135  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0215  protein of unknown function DUF255  31.09 
 
 
673 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1111  protein of unknown function DUF255  29.62 
 
 
699 aa  130  6e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.992934  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1579  protein of unknown function DUF255  28.62 
 
 
610 aa  130  6e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0984  hypothetical protein  25.63 
 
 
725 aa  130  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.29848  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1723  protein of unknown function DUF255  25.58 
 
 
665 aa  130  8.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0943  hypothetical protein  25.53 
 
 
718 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11330  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  30.13 
 
 
691 aa  129  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.234255  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1071  protein of unknown function DUF255  22.5 
 
 
662 aa  128  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2996  hypothetical protein  27.21 
 
 
700 aa  127  6e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2990  hypothetical protein  25.33 
 
 
696 aa  127  6e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.901065  hitchhiker  0.00330931 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1448  hypothetical protein  28.43 
 
 
672 aa  127  8.000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.411428  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3335  protein of unknown function DUF255  28.31 
 
 
699 aa  125  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000801567  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2991  protein of unknown function DUF255  25.75 
 
 
722 aa  125  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.784863  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1171  hypothetical protein  25.61 
 
 
660 aa  124  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1191  hypothetical protein  31.15 
 
 
675 aa  124  4e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1697  hypothetical protein  23.15 
 
 
669 aa  124  4e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1443  protein of unknown function DUF255  28.48 
 
 
670 aa  124  5e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2279  hypothetical protein  25.99 
 
 
700 aa  124  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1140  protein of unknown function DUF255  26.81 
 
 
737 aa  124  6e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0543  hypothetical protein  29.64 
 
 
703 aa  123  7e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2330  protein of unknown function DUF255  26.86 
 
 
693 aa  122  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00802642 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2855  protein of unknown function DUF255  24.27 
 
 
562 aa  123  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.864769  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0897  hypothetical protein  29.43 
 
 
644 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2247  protein of unknown function DUF255  24.05 
 
 
700 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1677  protein of unknown function DUF255  28.2 
 
 
733 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1395  protein of unknown function DUF255  26.61 
 
 
720 aa  121  3e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0132403  normal  0.87283 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1263  hypothetical protein  25.99 
 
 
678 aa  122  3e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.890044  normal  0.167783 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2401  hypothetical protein  28.16 
 
 
706 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000573334  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1214  hypothetical protein  27.3 
 
 
723 aa  120  9e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.372382  normal  0.0723033 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1372  protein of unknown function DUF255  26.11 
 
 
706 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2853  hypothetical protein  23.79 
 
 
690 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.329251  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2595  hypothetical protein  23.72 
 
 
681 aa  118  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1180  protein of unknown function DUF255  26.84 
 
 
707 aa  118  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2283  hypothetical protein  21.79 
 
 
700 aa  118  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1296  protein of unknown function DUF255  25.65 
 
 
744 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.212217  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0998  hypothetical protein  28.99 
 
 
705 aa  117  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1532  hypothetical protein  24.07 
 
 
641 aa  117  7.999999999999999e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.150478  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1004  protein of unknown function DUF255  25.53 
 
 
718 aa  117  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0451  hypothetical protein  21.25 
 
 
665 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1460  hypothetical protein  25.08 
 
 
720 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1067  hypothetical protein  25.58 
 
 
687 aa  115  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1665  hypothetical protein  27.69 
 
 
752 aa  114  5e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.590351  hitchhiker  0.000463934 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2409  hypothetical protein  31.03 
 
 
743 aa  114  5e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.260211  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1001  protein of unknown function DUF255  24.92 
 
 
718 aa  114  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.657059  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1631  protein of unknown function DUF255  26.67 
 
 
650 aa  114  7.000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1832  hypothetical protein  23.39 
 
 
669 aa  114  7.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.569096  normal  0.0946187 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2172  protein of unknown function DUF255  28.52 
 
 
714 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0500393  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0027  protein of unknown function DUF255  28.8 
 
 
671 aa  113  8.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000809407  normal  0.496902 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0945  protein of unknown function DUF255  20.48 
 
 
665 aa  113  8.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2549  hypothetical protein  27.3 
 
 
694 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282595  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1409  protein of unknown function DUF255  28.3 
 
 
581 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1902  protein of unknown function DUF255  25.31 
 
 
677 aa  111  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2727  hypothetical protein  24.92 
 
 
673 aa  110  8.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.461963 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1270  hypothetical protein  21.04 
 
 
676 aa  109  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.809248 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6036  hypothetical protein  25.52 
 
 
596 aa  109  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0507  protein of unknown function DUF255  25.99 
 
 
717 aa  109  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.056256  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2744  hypothetical protein  26.92 
 
 
676 aa  110  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.426615  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0712  protein of unknown function DUF255  25 
 
 
657 aa  109  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1765  hypothetical protein  26.28 
 
 
711 aa  109  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17317  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0345  hypothetical protein  26.42 
 
 
700 aa  108  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.308049  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3622  hypothetical protein  25.47 
 
 
680 aa  108  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.250871  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1310  protein of unknown function DUF255  24.92 
 
 
615 aa  109  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.92977  normal  0.0463256 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1315  hypothetical protein  29.55 
 
 
687 aa  109  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.529434  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31750  highly conserved protein containing a thioredoxin domain protein  27.45 
 
 
667 aa  108  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01057  DUF255 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G12370)  25.48 
 
 
774 aa  107  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0181431 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0863  hypothetical protein  29.64 
 
 
693 aa  108  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.477469  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0857  hypothetical protein  28.46 
 
 
676 aa  107  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0770505  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2043  hypothetical protein  26.58 
 
 
610 aa  107  7e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104906  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2848  hypothetical protein  25.4 
 
 
381 aa  106  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0929  hypothetical protein  24.41 
 
 
699 aa  106  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.991859  normal  0.115087 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1424  hypothetical protein  28.62 
 
 
593 aa  105  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1975  hypothetical protein  25.53 
 
 
582 aa  105  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0491  protein of unknown function DUF255  28.34 
 
 
682 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591903  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4477  protein of unknown function DUF255  19.06 
 
 
681 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0293  protein of unknown function DUF255  25.16 
 
 
839 aa  104  4e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>