22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0509 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0509  hypothetical protein  100 
 
 
165 aa  338  2e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0289752  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2493  hypothetical protein  32.84 
 
 
174 aa  72.4  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.256462  normal  0.792033 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1053  hypothetical protein  34.02 
 
 
180 aa  69.7  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal  0.267344 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1843  hypothetical protein  30.36 
 
 
169 aa  58.5  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1760  Domain of unknown function DUF1791  31.09 
 
 
166 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289316  normal  0.172768 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0256  hypothetical protein  30.59 
 
 
154 aa  53.1  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0557189  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0837  hypothetical protein  27.13 
 
 
188 aa  52.8  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0344498  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0547  hypothetical protein  28.35 
 
 
169 aa  53.1  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.733611  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0466  hypothetical protein  31.37 
 
 
115 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1221  hypothetical protein  25.38 
 
 
127 aa  50.8  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0130  hypothetical protein  29.25 
 
 
111 aa  50.4  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.314669  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2490  hypothetical protein  26.61 
 
 
161 aa  49.7  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0779  hypothetical protein  35.37 
 
 
115 aa  47.8  0.00006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.790907  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0468  hypothetical protein  27.45 
 
 
111 aa  46.2  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0179279  hitchhiker  0.0000000186223 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0015  hypothetical protein  29.57 
 
 
112 aa  45.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000351673  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2602  hypothetical protein  28.44 
 
 
115 aa  45.4  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00587907  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0267  hypothetical protein  28.19 
 
 
144 aa  44.7  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000206306  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3197  hypothetical protein  28.07 
 
 
114 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.218996 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0536  hypothetical protein  27.78 
 
 
123 aa  43.9  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1146  hypothetical protein  27.59 
 
 
160 aa  42.4  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.545594  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0095  Domain of unknown function DUF1791  26.09 
 
 
176 aa  42.4  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.921438  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6946  Domain of unknown function DUF1791  26.56 
 
 
151 aa  40.8  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>