49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1650 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1650  signal transduction protein  100 
 
 
446 aa  890    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.660835  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0094  signal transduction protein  37.62 
 
 
436 aa  138  2e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.41097  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1492  accessory gene regulator protein C  30.77 
 
 
429 aa  130  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.108947  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3005  histidine kinase domain protein  31.56 
 
 
406 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000219029 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3042  histidine kinase domain protein  30.8 
 
 
406 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00679309  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3043  histidine kinase domain-containing protein  30.8 
 
 
438 aa  120  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.795869  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2795  histidine kinase domain-containing protein  31.7 
 
 
438 aa  120  6e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.921315  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2744  histidine kinase  31.25 
 
 
438 aa  120  6e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00108764  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3007  histidine kinase domain-containing protein  31.7 
 
 
438 aa  120  6e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2724  sensor histidine kinase  31.25 
 
 
438 aa  120  7e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.276945  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0009  signal transduction protein  33.47 
 
 
277 aa  97.8  4e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1311  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.84 
 
 
443 aa  94.4  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.766434  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3869  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  23.74 
 
 
540 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0780654  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0401  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.98 
 
 
479 aa  56.2  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01630  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  24.89 
 
 
325 aa  53.5  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4414  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25.37 
 
 
558 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0680  sensor kinase DpiB  24.64 
 
 
553 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.520362  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0666  sensor kinase DpiB  24.64 
 
 
553 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.863518  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0784  sensor kinase DpiB  24.64 
 
 
553 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.636686  normal  0.450792 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0740  sensor kinase DpiB  24.64 
 
 
553 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4346  sensor histidine kinase  25.98 
 
 
529 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.149156  hitchhiker  0.000000000000186115 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0499  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.92 
 
 
287 aa  50.1  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000111074  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1009  sensor histidine kinase  25.5 
 
 
529 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1089  sensor histidine kinase  25.5 
 
 
529 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1570  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.36 
 
 
278 aa  48.9  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000677983 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2269  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  23.95 
 
 
442 aa  48.5  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3117  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25.23 
 
 
430 aa  48.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0965  sensor histidine kinase  26.73 
 
 
529 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0869  sensor histidine kinase  25 
 
 
529 aa  47.4  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0923  sensor histidine kinase  25 
 
 
529 aa  47.4  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1622  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  22.06 
 
 
275 aa  47  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1004  sensor histidine kinase  26.7 
 
 
529 aa  47  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.68776e-61 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2125  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  23.32 
 
 
431 aa  46.6  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.145856  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0745  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  23.63 
 
 
460 aa  45.1  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0811  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.73 
 
 
529 aa  45.8  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2862  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  22.58 
 
 
434 aa  45.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000109572  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0834  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.47 
 
 
540 aa  45.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0952704  normal  0.0982471 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0032  histidine kinase-related ATPase, putative  24.42 
 
 
248 aa  44.7  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000737644  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4699  sensory histidine kinase DcuS  32.32 
 
 
543 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4559  sensory histidine kinase DcuS  32.32 
 
 
543 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4650  sensory histidine kinase DcuS  32.32 
 
 
543 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4650  sensory histidine kinase DcuS  32.32 
 
 
543 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.414572  normal  0.461897 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0500  sensor histidine kinase  23.1 
 
 
516 aa  44.7  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0837  sensor histidine kinase  24.02 
 
 
529 aa  44.7  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0904  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25.11 
 
 
241 aa  44.7  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0511  sensor histidine kinase  23.67 
 
 
516 aa  43.9  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0469  ATP-binding region ATPase domain protein  23.27 
 
 
444 aa  43.5  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3117  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  23.78 
 
 
342 aa  43.5  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.853672  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8198  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  21.61 
 
 
538 aa  43.1  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>