48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0469 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0469  ATP-binding region ATPase domain protein  100 
 
 		 444 aa  906    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02250  histidine kinase  42.4 
 
 		 450 aa  331  2e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1751  sensor histidine kinase VirS  33.17 
 
 		 440 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0035916  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1481  sensor histidine kinase VirS  32.67 
 
 		 441 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000161061  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0975  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.91 
 
 		 242 aa  100  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2269  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.23 
 
 		 442 aa  98.2  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0582  signal transduction protein  27.94 
 
 		 431 aa  81.6  0.00000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2641  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.14 
 
 		 423 aa  80.5  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2545  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25.85 
 
 		 361 aa  80.5  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.290644  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2346  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  23.39 
 
 		 609 aa  79  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.600899 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2424  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  24.78 
 
 		 423 aa  74.7  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0499  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.64 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000111074  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0499  sensor histidine kinase  26.57 
 
 		 431 aa  70.9  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000246195  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3117  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.1 
 
 		 342 aa  70.1  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.853672  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0032  histidine kinase-related ATPase, putative  27 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000737644  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01630  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.24 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2647  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  22.91 
 
 		 426 aa  62.8  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0487  sensor histidine kinase  27.05 
 
 		 431 aa  62  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0885624  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1601  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  32.11 
 
 		 446 aa  60.1  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00658825  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2401  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  24.76 
 
 		 456 aa  58.9  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.283788  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0430  ATP-binding region ATPase domain protein  26.03 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000157774 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0745  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25.45 
 
 		 460 aa  56.6  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3198  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  24.14 
 
 		 456 aa  56.2  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000728956 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1870  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25.51 
 
 		 470 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000031179  normal  0.169965 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0401  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.61 
 
 		 479 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4665  histidine kinase  27.74 
 
 		 502 aa  51.6  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3688  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  22.73 
 
 		 280 aa  49.7  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2769  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.14 
 
 		 303 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2841  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.86 
 
 		 445 aa  48.5  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0250  histidine kinase  32 
 
 		 501 aa  48.5  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.162679  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.82 
 
 		 480 aa  48.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4800  sensory transduction protein  29.05 
 
 		 502 aa  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0181397  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1814  ATP-binding region ATPase domain protein  30.77 
 
 		 614 aa  47.4  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.211625  normal  0.35963 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5253  sensory transduction protein  29.33 
 
 		 481 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6296  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 464 aa  47  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162376  normal  0.252701 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 468 aa  47  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2936  histidine kinase  25.68 
 
 		 517 aa  45.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00120898  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0904  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25.45 
 
 		 241 aa  45.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0323  sensor histidine kinase  31.2 
 
 		 501 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000371797  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0304  sensor histidine kinase  31.2 
 
 		 469 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0202575  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0295  sensor histidine kinase  31.2 
 
 		 501 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0297  sensor histidine kinase  31.2 
 
 		 480 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3506  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.33 
 
 		 450 aa  44.3  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.996611 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0281  sensor histidine kinase  24.29 
 
 		 475 aa  43.9  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.012454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4011  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 		 446 aa  43.9  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.704889  hitchhiker  0.0000182562 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4414  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.76 
 
 		 558 aa  43.5  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22040  signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 		 428 aa  43.1  0.01  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 		 446 aa  43.1  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000501512  normal  0.872654 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>