263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1708 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2898  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  76.36 
 
 		 428 aa  678    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.669885  normal  0.828985 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1526  acetyl-CoA hydrolase/transferase  93.69 
 
 		 428 aa  829    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1708  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  100 
 
 		 428 aa  875    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1423  acetyl-CoA hydrolase/transferase  92.99 
 
 		 428 aa  820    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1552  acetyl-CoA hydrolase/transferase  93.69 
 
 		 428 aa  827    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1517  acetyl-CoA hydrolase/transferase  93.69 
 
 		 428 aa  827    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2399  acetyl-CoA hydrolase/transferase  84.11 
 
 		 428 aa  756    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.813722 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2830  acetyl-CoA hydrolase/transferase  93.69 
 
 		 428 aa  828    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.672634  normal  0.961785 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3493  acetyl-CoA hydrolase/transferase  84.11 
 
 		 428 aa  756    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.786006 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2572  acetyl-CoA hydrolase/transferase  95.56 
 
 		 449 aa  844    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2639  acetyl-CoA hydrolase/transferase  95.56 
 
 		 449 aa  843    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0862  acetyl-CoA hydrolase/transferase  82.01 
 
 		 428 aa  731    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2747  acetyl-CoA hydrolase/transferase  95.33 
 
 		 428 aa  839    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0809  acetyl-CoA hydrolase/transferase  58.03 
 
 		 428 aa  480  1e-134  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0965  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  55.58 
 
 		 424 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.201698  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1010  acetyl-CoA hydrolase/transferase  55.34 
 
 		 424 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763151 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0060  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  54.78 
 
 		 430 aa  462  1e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0404661  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1024  acetyl-CoA hydrolase/transferase  55.34 
 
 		 424 aa  463  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825013  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1027  acetyl-CoA hydrolase/transferase  55.11 
 
 		 424 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719595  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2889  acetyl-CoA hydrolase/transferase  52.97 
 
 		 430 aa  461  9.999999999999999e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000123716  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2104  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  53.35 
 
 		 432 aa  459  9.999999999999999e-129  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2715  acetyl-CoA hydrolase/transferase  54.07 
 
 		 429 aa  459  9.999999999999999e-129  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.268701  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2254  acetyl-CoA hydrolase/transferase  53.92 
 
 		 428 aa  451  1e-125  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1894  acetyl-CoA hydrolase/transferase  53.97 
 
 		 428 aa  446  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4998  acetyl-CoA hydrolase/transferase  53.19 
 
 		 432 aa  443  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.410029  normal  0.0205642 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2497  acetyl-CoA hydrolase/transferase  51.2 
 
 		 427 aa  435  1e-121  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.242063  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2513  acetyl-CoA hydrolase/transferase  51.2 
 
 		 430 aa  432  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0317951  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1257  acetyl-CoA hydrolase/transferase  52.31 
 
 		 453 aa  429  1e-119  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1613  acetyl-CoA hydrolase/transferase  52.13 
 
 		 455 aa  427  1e-118  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.925484 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0911  acetyl-CoA hydrolase/transferase  52.78 
 
 		 431 aa  423  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3773  acetyl-CoA hydrolase/transferase  52.78 
 
 		 431 aa  419  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232234  normal  0.702768 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1748  acetyl-CoA hydrolase/transferase  51.73 
 
 		 611 aa  409  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0057  acetyl-CoA hydrolase/transferase  48.18 
 
 		 420 aa  408  1.0000000000000001e-112  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2824  acetyl-CoA hydrolase/transferase  49.14 
 
 		 616 aa  395  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2142  GCN5-related N-acetyltransferase:Acetyl-CoA hydrolase/transferase  49.88 
 
 		 617 aa  392  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1430  acetyl-CoA hydrolase/transferase  48.17 
 
 		 616 aa  389  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0209565  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1793  acetyl-CoA hydrolase/transferase  48.28 
 
 		 614 aa  382  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00194756  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1656  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase, putative/acetyltransferase, GNAT family protein  46.55 
 
 		 622 aa  373  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0603  acetyl-CoA hydrolase/transferase  43.13 
 
 		 434 aa  375  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00185  fused 4-Hydroxybutyrate CoA-transferase/acetyltransferase domain of GNAT  47.77 
 
 		 615 aa  374  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0950  acetyl-CoA hydrolase/transferase  45.85 
 
 		 443 aa  373  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.540968  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0690  4-hydroxybutyrate CoA-transferase  44.29 
 
 		 431 aa  371  1e-101  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000582871 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3070  acetyl-CoA hydrolase/transferase  46.94 
 
 		 645 aa  370  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155657 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1418  acetyl-CoA hydrolase/transferase  44.42 
 
 		 445 aa  368  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2862  acetyl-CoA hydrolase/transferase  44.18 
 
 		 445 aa  365  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1193  acetyl-CoA hydrolase/transferase  43 
 
 		 623 aa  348  1e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000807125  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0619  acetyl-CoA hydrolase/transferase  43.34 
 
 		 627 aa  343  5e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1278  acetyl-CoA hydrolase/transferase  44.77 
 
 		 634 aa  342  5e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.863753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19050  acetyl-CoA hydrolase/transferase  42.51 
 
 		 428 aa  340  4e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1956  4-hydroxybutyrate CoA-transferase  41.47 
 
 		 431 aa  337  2.9999999999999997e-91  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0086  acetyl-CoA hydrolase/transferase  44.64 
 
 		 636 aa  335  1e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3573  acetyl-CoA hydrolase/transferase  41.87 
 
 		 437 aa  325  9e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0018283  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3294  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.47 
 
 		 437 aa  318  1e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0716  acetyl-CoA hydrolase/transferase  40.19 
 
 		 431 aa  318  1e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.413147  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3745  acetyl-CoA hydrolase/transferase  40.68 
 
 		 432 aa  316  6e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3304  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  41.35 
 
 		 437 aa  311  2e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0283  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.83 
 
 		 431 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.230364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1439  acetyl-CoA hydrolase/transferase  40.19 
 
 		 437 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2815  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.71 
 
 		 437 aa  303  6.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0053  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.47 
 
 		 431 aa  300  3e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.123416 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2303  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  39.9 
 
 		 443 aa  300  4e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2054  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.81 
 
 		 441 aa  300  4e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0198226  hitchhiker  0.00000220967 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0701  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  39.9 
 
 		 443 aa  299  6e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2220  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  39.9 
 
 		 443 aa  299  6e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.204063  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1651  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  39.67 
 
 		 443 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1934  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  39.67 
 
 		 443 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.861274  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0610  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  39.67 
 
 		 445 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.684437  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1727  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  39.67 
 
 		 443 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0746  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.52 
 
 		 634 aa  292  9e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1315  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.2 
 
 		 441 aa  290  4e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1561  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.18 
 
 		 437 aa  290  4e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.211696  normal  0.891622 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0532  acetyl-CoA hydrolase  40.19 
 
 		 432 aa  289  6e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000818274  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1735  acetyl-CoA hydrolase  37.86 
 
 		 431 aa  286  4e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000187656  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2743  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.81 
 
 		 432 aa  281  1e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2513  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.67 
 
 		 479 aa  281  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1744  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39 
 
 		 444 aa  281  2e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4529  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.59 
 
 		 446 aa  280  4e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3462  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  39.77 
 
 		 441 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.366103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3360  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  39.77 
 
 		 441 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3367  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  39.77 
 
 		 441 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.729069 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3293  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  39.77 
 
 		 441 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.326254 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1579  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.77 
 
 		 433 aa  272  7e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2158  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  40.05 
 
 		 440 aa  272  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2116  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  39.81 
 
 		 440 aa  270  2.9999999999999997e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.449601 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2268  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.81 
 
 		 440 aa  270  2.9999999999999997e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3253  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.71 
 
 		 407 aa  268  1e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.301436  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3916  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.3 
 
 		 442 aa  267  2.9999999999999995e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0516  acetyl-CoA hydrolase  38.57 
 
 		 438 aa  265  1e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1976  acetyl-CoA hydrolase/transferase  35.68 
 
 		 633 aa  265  2e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2858  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.82 
 
 		 446 aa  263  6e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1489  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.94 
 
 		 447 aa  260  3e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0436  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  37.47 
 
 		 446 aa  259  9e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2267  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.73 
 
 		 448 aa  258  1e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0630607  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2137  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.32 
 
 		 445 aa  257  2e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.758838  normal  0.0258609 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0352  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.32 
 
 		 447 aa  257  3e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7279  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.42 
 
 		 430 aa  255  8e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2025  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.62 
 
 		 449 aa  253  4.0000000000000004e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000691604  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1932  hypothetical protein  40.23 
 
 		 447 aa  251  2e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0382  acetyl-CoA hydrolase/transferase  34.65 
 
 		 448 aa  247  3e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2447  putative acetyl-CoA hydrolase  35.42 
 
 		 445 aa  246  6e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>