More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A0852 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A0852  formimidoylglutamase  100 
 
 
313 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0883  formimidoylglutamase  99.36 
 
 
313 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0915  formimidoylglutamase  99.04 
 
 
313 aa  633  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0938  formimidoylglutamase  98.72 
 
 
313 aa  632  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.62567 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0824  formimidoylglutamase  98.72 
 
 
313 aa  632  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1261  formimidoylglutamase  64.86 
 
 
312 aa  400  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1591  formimidoylglutamase  49.02 
 
 
316 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854602  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1031  formimidoylglutamase  42.73 
 
 
348 aa  236  3e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.454798  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5045  formimidoylglutamase  45.78 
 
 
329 aa  233  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2046  formimidoylglutamase  42.99 
 
 
322 aa  227  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.55166  normal  0.477762 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23170  formimidoylglutamase  44.84 
 
 
311 aa  225  6e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000566858 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2388  formimidoylglutamase  42.59 
 
 
315 aa  225  9e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.770652  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2795  formimidoylglutamase  42.9 
 
 
315 aa  222  6e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4072  formimidoylglutamase  47.02 
 
 
311 aa  221  8e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2879  formimidoylglutamase  42.81 
 
 
325 aa  219  5e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0824  formimidoylglutamase  42.86 
 
 
336 aa  219  5e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000103972  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4413  formimidoylglutamase  41.58 
 
 
320 aa  217  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.624184 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1954  formimidoylglutamase  43.09 
 
 
311 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0479136  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2473  formimidoylglutamase  42.49 
 
 
325 aa  216  5e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.730979  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003721  formiminoglutamase  40.85 
 
 
336 aa  216  5e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2645  formimidoylglutamase  43.18 
 
 
325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0232342  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0706  formimidoylglutamase  40.54 
 
 
344 aa  213  2.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.979825  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02074  formimidoylglutamase  39.38 
 
 
345 aa  212  4.9999999999999996e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0599  formimidoylglutamase  44.52 
 
 
325 aa  211  2e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00699527 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0746  formimidoylglutamase  37.03 
 
 
319 aa  209  5e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0764  formimidoylglutamase  37.34 
 
 
319 aa  209  7e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1933  formimidoylglutamase  40.92 
 
 
363 aa  203  3e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.541509  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02330  formimidoylglutamase  41.11 
 
 
348 aa  200  1.9999999999999998e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0849  formimidoylglutamase  37 
 
 
358 aa  198  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0322036 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30730  formiminoglutamase  43.63 
 
 
329 aa  194  1e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0379  formimidoylglutamase  42.21 
 
 
323 aa  186  5e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1018  formiminoglutamase  37.74 
 
 
326 aa  185  9e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03170  formiminoglutamase  40.72 
 
 
317 aa  182  8.000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2010  formiminoglutamase  38.05 
 
 
333 aa  181  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.547952  normal  0.0717595 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03130  probable arginase family protein  35.8 
 
 
334 aa  172  6.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2402  formimidoylglutamase  31.86 
 
 
311 aa  169  6e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2359  formimidoylglutamase  31.86 
 
 
311 aa  169  6e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1919  formimidoylglutamase  32.9 
 
 
311 aa  165  6.9999999999999995e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2157  formiminoglutamase  37.19 
 
 
322 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1279  formiminoglutamase  34.62 
 
 
325 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1596  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  32.38 
 
 
316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4042  formiminoglutamase  32.32 
 
 
304 aa  96.7  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.954236  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2732  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  28.37 
 
 
311 aa  96.7  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.167247  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3735  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  31.41 
 
 
316 aa  91.7  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498261  normal  0.103946 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3835  formiminoglutamase  31.29 
 
 
328 aa  91.3  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4106  formiminoglutamase  31.75 
 
 
332 aa  91.3  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2764  agmatinase  24.74 
 
 
345 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.255476  normal  0.814002 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2734  agmatinase  24.4 
 
 
345 aa  89  9e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2778  agmatinase  24.4 
 
 
345 aa  89  9e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470269  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3303  putative agmatinase  24.4 
 
 
340 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.345323  normal  0.151363 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2290  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  27.74 
 
 
312 aa  84.7  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1098  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  27.74 
 
 
305 aa  84  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.680676  normal  0.149634 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3439  formimidoylglutamase  25.96 
 
 
323 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3351  formimidoylglutamase  25.96 
 
 
323 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3659  formimidoylglutamase  25.96 
 
 
323 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3709  formimidoylglutamase  25.96 
 
 
323 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.545495  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3677  formimidoylglutamase  25.96 
 
 
323 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.707468  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0848  agmatinase  27.2 
 
 
340 aa  81.6  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.384974  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3757  formimidoylglutamase  25.96 
 
 
323 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1559  formimidoylglutamase  25.96 
 
 
323 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.459006  normal  0.0875298 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3336  formimidoylglutamase  26.32 
 
 
323 aa  82  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.301376  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5671  putative agmatinase  26.82 
 
 
369 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3682  formimidoylglutamase  25.96 
 
 
323 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0214303  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5725  agmatinase  25.86 
 
 
346 aa  81.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.672273 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3402  formimidoylglutamase  25.61 
 
 
323 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.786826  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3024  putative agmatinase  24.49 
 
 
354 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197883  normal  0.651701 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0420  agmatinase  25.08 
 
 
309 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00981885  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0907  arginase  28.91 
 
 
302 aa  76.6  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.160766  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3201  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  27.8 
 
 
345 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.791135  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3224  agmatinase  25.09 
 
 
333 aa  72  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.583379  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3103  agmatinase  26.92 
 
 
323 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  28.72 
 
 
326 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2470  arginase  28.77 
 
 
322 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.014347  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  28.72 
 
 
326 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0207  agmatinase  26.35 
 
 
290 aa  71.6  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.973687  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0321  arginase  29.19 
 
 
298 aa  71.2  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0153  arginase  25 
 
 
300 aa  71.2  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000739593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  28.72 
 
 
326 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06738  agmatinase  23.37 
 
 
306 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0232  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  26.1 
 
 
328 aa  70.9  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0462  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  26.25 
 
 
338 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000829  agmatinase  22.9 
 
 
306 aa  69.7  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000138178  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2309  formimidoylglutamase  23.4 
 
 
322 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3460  agmatinase  24.43 
 
 
291 aa  69.3  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4832  agmatinase  24.03 
 
 
378 aa  69.3  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5218  agmatinase  23.88 
 
 
290 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5050  agmatinase (agmatine ureohydrolase)  23.88 
 
 
290 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5617  agmatinase  23.88 
 
 
290 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0277  agmatinase  25.57 
 
 
322 aa  68.9  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.17372 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5461  putative agmatinase  23.88 
 
 
290 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2118  agmatinase  26.57 
 
 
263 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40880  agmatinase  23.99 
 
 
416 aa  68.6  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0860  agmatinase  25.94 
 
 
309 aa  68.2  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.806171  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4095  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  28.28 
 
 
347 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5066  agmatinase (agmatine ureohydrolase)  23.88 
 
 
290 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1082  agmatinase  21.82 
 
 
396 aa  67  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.193569  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4700  agmatinase  27.15 
 
 
318 aa  67  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6083  agmatinase  27.95 
 
 
316 aa  67  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  0.214815 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5163  putative agmatinase  24.53 
 
 
290 aa  67  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4273  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  32.18 
 
 
323 aa  66.6  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>