36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1868 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1868  transporter, putative  100 
 
 		 300 aa  582  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.593615  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2354  Urea transporter  54.33 
 
 		 301 aa  342  4e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2311  Urea transporter  54.33 
 
 		 301 aa  342  4e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1138  urea transporter  32.9 
 
 		 330 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.138675  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3561  urea transporter  32.9 
 
 		 330 aa  150  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.493557  normal  0.0101764 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1084  urea transporter  32.9 
 
 		 330 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0682  Urea transporter  33.45 
 
 		 312 aa  145  7.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2884  Urea transporter  29.07 
 
 		 371 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1892  Urea transporter  27.42 
 
 		 337 aa  125  7e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0862961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2440  Urea transporter  30.38 
 
 		 347 aa  120  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0316485  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1245  Urea transporter  29.87 
 
 		 321 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2711  putative UreA transporter  27.12 
 
 		 344 aa  116  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.896357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4829  Urea transporter  29.51 
 
 		 286 aa  112  7.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2069  Urea transporter  28.57 
 
 		 281 aa  110  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000722632  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1363  urea transporter, putative  28.2 
 
 		 350 aa  109  6e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.641348  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1300  urea transporter  28.43 
 
 		 337 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5121  urea transporter  27.72 
 
 		 338 aa  100  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.47662 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4874  Urea transporter  26.57 
 
 		 314 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0687678  normal  0.634987 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1462  urea transporter  28.09 
 
 		 337 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1794  Urea transporter  25.44 
 
 		 314 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000232092 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4315  putative urea transporter  25.26 
 
 		 290 aa  80.5  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1593  Urea transporter  28.09 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0322778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4532  Urea transporter  22.68 
 
 		 296 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.16763 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4073  Urea transporter  23.23 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.413684 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3367  Urea transporter  23.26 
 
 		 316 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000898038  hitchhiker  0.0000000000000178503 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4679  Urea transporter  23.85 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0971764 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3688  Urea transporter  23.85 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4302  Urea transporter  27.46 
 
 		 291 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03500  urea transporter  22.01 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1567  Urea transporter  25.44 
 
 		 290 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0796625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3867  Urea transporter  26.74 
 
 		 292 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.464169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5621  Urea transporter  21.72 
 
 		 296 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3627  Urea transporter  26.21 
 
 		 291 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.075407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1140  Urea transporter  21.57 
 
 		 297 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2774  Urea transporter  25.17 
 
 		 303 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.131823  normal  0.29539 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39772  predicted protein  27.97 
 
 		 432 aa  43.5  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.140327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>