18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0932 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG0932  Tn916, transcriptional regulator, putative  100 
 
 		 401 aa  831    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2017  Cro/CI family transcriptional regulator  28.61 
 
 		 429 aa  126  6e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.744887  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1044  transcriptional regulator  25.19 
 
 		 542 aa  107  4e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.547472  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2114  hypothetical protein  26.48 
 
 		 342 aa  97.4  4e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00301162  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1988  hypothetical protein  27.94 
 
 		 342 aa  85.1  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1756  replication initiation factor  23.42 
 
 		 345 aa  60.5  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008500  STER_A3  transcriptional regulator  23.62 
 
 		 368 aa  55.8  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1588  replication initiation factor  26.44 
 
 		 340 aa  48.9  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1577  replication initiation factor  26.44 
 
 		 340 aa  48.9  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1566  replication initiation factor  26.44 
 
 		 340 aa  48.9  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2160  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 272 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2653  Cro/CI family transcriptional regulator  45 
 
 		 272 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  32.99 
 
 		 256 aa  43.9  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0647  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 209 aa  43.5  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9067299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0591  transcriptional regulator, XRE family  45.1 
 
 		 68 aa  43.5  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0633  putative phage repressor  45.45 
 
 		 209 aa  43.1  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.681909  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0408  transcriptional regulator, XRE family  44 
 
 		 63 aa  43.1  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  42 
 
 		 128 aa  42.7  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>