30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0550 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0550  hypothetical protein  100 
 
 
74 aa  151  2e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0129436  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1158  hypothetical protein  60.81 
 
 
73 aa  92  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00402428  hitchhiker  0.0000171721 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2547  hypothetical protein  61.97 
 
 
77 aa  88.6  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4662  hypothetical protein  55.56 
 
 
74 aa  85.5  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.2161  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4664  hypothetical protein  52.7 
 
 
74 aa  85.1  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.554715  normal  0.203838 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1147  hypothetical protein  56.16 
 
 
79 aa  84.7  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.62198  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1259  hypothetical protein  65.75 
 
 
74 aa  85.1  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2918  hypothetical protein  49.32 
 
 
75 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.386014 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3239  hypothetical protein  56.76 
 
 
76 aa  80.5  0.000000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.551481  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1825  hypothetical protein  52.7 
 
 
73 aa  73.9  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0055  hypothetical protein  48.61 
 
 
88 aa  73.6  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0426  hypothetical protein  42.47 
 
 
77 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1887  hypothetical protein  47.69 
 
 
80 aa  68.2  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127814  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4786  hypothetical protein  44.26 
 
 
66 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0609  hypothetical protein  43.75 
 
 
74 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1092  hypothetical protein  43.75 
 
 
76 aa  59.7  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1487  hypothetical protein  45.31 
 
 
69 aa  59.7  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0024  hypothetical protein  40.85 
 
 
77 aa  57  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1132  hypothetical protein  38.03 
 
 
77 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2062  hypothetical protein  39.13 
 
 
69 aa  53.1  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000919693  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2471  hypothetical protein  39.68 
 
 
76 aa  52.8  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0192459 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5758  hypothetical protein  39.19 
 
 
74 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4683  hypothetical protein  37.68 
 
 
125 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5132  hypothetical protein  41.54 
 
 
66 aa  47.8  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569085  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0820  hypothetical protein  41.07 
 
 
74 aa  47.4  0.00007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0605  hypothetical protein  34.78 
 
 
72 aa  45.4  0.0003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2226  hypothetical protein  35.21 
 
 
74 aa  44.3  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.972596  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5177  hypothetical protein  36.23 
 
 
123 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.492056  normal  0.750355 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5597  hypothetical protein  43.94 
 
 
77 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1402  hypothetical protein  30.14 
 
 
102 aa  40  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>