16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3647 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3647  hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.149375 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3612  hypothetical protein  64.16 
 
 
297 aa  367  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5365  hypothetical protein  42.45 
 
 
289 aa  196  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4388  hypothetical protein  39.79 
 
 
285 aa  194  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.112104  normal  0.0499819 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4821  hypothetical protein  40.07 
 
 
275 aa  176  6e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.619327  normal  0.458866 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3907  hypothetical protein  35.31 
 
 
290 aa  169  7e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6077  hypothetical protein  38.49 
 
 
293 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2374  hypothetical protein  34.69 
 
 
289 aa  156  4e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1436  hypothetical protein  32.39 
 
 
284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.878588  hitchhiker  0.0000170273 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3081  hypothetical protein  32.97 
 
 
283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6080  hypothetical protein  28.98 
 
 
285 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3157  hypothetical protein  76.6 
 
 
121 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.97591 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5673  hypothetical protein  34.62 
 
 
183 aa  59.7  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1110  hypothetical protein  34.34 
 
 
147 aa  45.8  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00185797  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3072  hypothetical protein  28.33 
 
 
130 aa  44.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.49462  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3073  hypothetical protein  28.65 
 
 
184 aa  43.5  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.730608  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>