28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0773 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_2097  putative FtsL  100 
 
 
119 aa  238  2e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0773  putative FtsL  100 
 
 
119 aa  238  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.440113  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0684  hypothetical protein  92.44 
 
 
119 aa  224  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.428202  normal  0.243633 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2016  hypothetical protein  64 
 
 
115 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0584  hypothetical protein  61.7 
 
 
127 aa  119  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.206674  normal  0.156127 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2473  hypothetical protein  58.76 
 
 
118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.540136 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2768  hypothetical protein  54.44 
 
 
119 aa  102  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.36439  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2414  hypothetical protein  36.19 
 
 
123 aa  60.8  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1044  hypothetical protein  33.33 
 
 
126 aa  51.2  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.962919 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0957  secreted (periplasmic) protein-like  32.97 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1272  hypothetical protein  31.62 
 
 
126 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5179  putative exported protein of unknown function  35.48 
 
 
143 aa  47  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3478  hypothetical protein  34.18 
 
 
126 aa  47  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5103  hypothetical protein  35.42 
 
 
143 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1737  hypothetical protein  26.58 
 
 
133 aa  44.7  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4640  hypothetical protein  35.42 
 
 
143 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0336468 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3401  hypothetical protein  34.91 
 
 
127 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0669705  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1987  hypothetical protein  31.43 
 
 
127 aa  42.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0646582  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2364  hypothetical protein  40 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85477  normal  0.0631893 
 
 
-
 
NC_004310  BR1438  hypothetical protein  25.32 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371938  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5470  hypothetical protein  34.38 
 
 
153 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0809121  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0685  hypothetical protein  38.89 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.173573 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0262  hypothetical protein  39.06 
 
 
164 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.042109  normal  0.0475233 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1395  hypothetical protein  25.32 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.549071  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2187  hypothetical protein  31.37 
 
 
126 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0734029  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6181  hypothetical protein  30.95 
 
 
130 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.356695 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2014  hypothetical protein  23.89 
 
 
128 aa  40.8  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4055  hypothetical protein  33 
 
 
127 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0047292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>