More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4389 on replicon NC_009432
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009432  Rsph17025_4389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 
246 aa  501  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00000188924  normal  0.759718 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4305  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.17 
 
 
360 aa  113  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0467548  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6445  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.52 
 
 
360 aa  112  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.67633  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0014  putative ParA-like (IncC) ATPase  31.93 
 
 
294 aa  112  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.118002 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6602  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.08 
 
 
358 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4224  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.33 
 
 
260 aa  103  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.323869  normal 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0038  plasmid partition protein  31.58 
 
 
361 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2257  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.42 
 
 
359 aa  99.8  3e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.69947  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0438  putative CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  26.44 
 
 
250 aa  93.6  3e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.132493  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0782  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30 
 
 
281 aa  93.2  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000350722 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2334  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.8 
 
 
249 aa  91.7  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3050  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.7 
 
 
252 aa  90.9  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284037  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3569  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.62 
 
 
252 aa  90.9  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  hitchhiker  0.00440484 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6265  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.47 
 
 
280 aa  88.2  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0454468  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4974  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.99 
 
 
282 aa  87.8  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1407  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.31 
 
 
267 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0079  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.87 
 
 
256 aa  87.4  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13239  hypothetical protein  31 
 
 
266 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.614127  normal  0.5818 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3194  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.24 
 
 
249 aa  86.7  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3421  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29 
 
 
257 aa  86.3  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.786634  normal 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0013  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.74 
 
 
257 aa  86.3  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690723  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4704  hypothetical protein  28.91 
 
 
460 aa  85.5  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.155939  normal  0.801258 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1789  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.41 
 
 
264 aa  85.1  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247276  normal  0.400701 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2816  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.59 
 
 
260 aa  85.1  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.317638  normal  0.393474 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3212  chromosome partitioning protein parA  29.59 
 
 
260 aa  85.1  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1114  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.74 
 
 
272 aa  84  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.114228  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5812  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.24 
 
 
262 aa  83.6  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0049  putative ParA partition protein  26.52 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2856  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.95 
 
 
260 aa  83.6  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.225227 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3903  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.26 
 
 
262 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0188  chromosome partitioning protein ParA  30.05 
 
 
260 aa  83.6  0.000000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.946559  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0095  ParA family chromosome partitioning ATPase  28.92 
 
 
261 aa  82.4  0.000000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4678  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.74 
 
 
267 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993482  normal  0.214057 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0135  ParA family chromosome partitioning ATPase  28.92 
 
 
261 aa  82.4  0.000000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4668  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.14 
 
 
255 aa  82.8  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.016966  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0107  ParA family chromosome partitioning ATPase  28.92 
 
 
261 aa  82.4  0.000000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4937  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.1 
 
 
276 aa  82.4  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0647563  normal  0.762584 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4334  ParA family protein  29.39 
 
 
262 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.873064  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1533  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.39 
 
 
262 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222444  normal  0.344504 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0006  ParA family protein  32.09 
 
 
258 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0843826  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3660  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.23 
 
 
263 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2993  chromosome partitioning ATPase  27.24 
 
 
315 aa  81.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3835  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.56 
 
 
316 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.10007  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3898  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.11 
 
 
316 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475891  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1467  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.35 
 
 
274 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.162034  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0680  sporulation initiation inhibitor protein soj  30.65 
 
 
262 aa  80.5  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.411466  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3976  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.11 
 
 
316 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0294413  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0134  chromosome segregation ATPase  26.87 
 
 
258 aa  80.5  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0048  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.83 
 
 
256 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.627572  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3948  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.99 
 
 
316 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.056511 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0029  chromosome segregation ATPase  33.83 
 
 
256 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.158889 
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0047  replication-associated protein  27.12 
 
 
288 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1410  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.75 
 
 
261 aa  80.1  0.00000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1423  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.98 
 
 
328 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.854251  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0359  sporulation initiation inhibitor protein soj  27.36 
 
 
260 aa  80.5  0.00000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00437391  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2979  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.31 
 
 
257 aa  79.7  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15220  chromosome partitioning ATPase  27.53 
 
 
314 aa  79.7  0.00000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0209681  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.41 
 
 
284 aa  79.3  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0472  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.32 
 
 
265 aa  79.3  0.00000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2164  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.52 
 
 
260 aa  79.3  0.00000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.441053  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0722  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.88 
 
 
284 aa  79.3  0.00000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1454  chromosome partitioning protein  26.02 
 
 
262 aa  79.3  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.31 
 
 
298 aa  79.3  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.630454  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2947  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.2 
 
 
290 aa  79  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297799  normal  0.346271 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.2 
 
 
279 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2976  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.2 
 
 
290 aa  79  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  30.22 
 
 
253 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2753  chromosome segregation ATPase  28.57 
 
 
262 aa  79  0.00000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00357509  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3864  putative plasmid partitioning protein  28.33 
 
 
262 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.22 
 
 
253 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.22 
 
 
253 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.22 
 
 
253 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.22 
 
 
253 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  30.22 
 
 
253 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0915  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.16 
 
 
275 aa  78.6  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412343  normal  0.210733 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5392  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.12 
 
 
288 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.28494  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.22 
 
 
253 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.22 
 
 
253 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.22 
 
 
253 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3293  chromosome segregation ATPase  27.59 
 
 
255 aa  78.6  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1570  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.57 
 
 
262 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601038  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4519  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.91 
 
 
313 aa  78.6  0.00000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.187325  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5429  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.67 
 
 
322 aa  77.8  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11094  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2844  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.03 
 
 
268 aa  77.8  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2878  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.41 
 
 
277 aa  78.2  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.504433  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3498  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.59 
 
 
303 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.975248  normal  0.228635 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5943  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.17 
 
 
252 aa  77.4  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.22 
 
 
253 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4159  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.97 
 
 
258 aa  77.8  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1707  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.24 
 
 
269 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45520  putative plasmid partitioning protein  27.92 
 
 
262 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.922179 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1532  SpoOJ regulator protein  30.1 
 
 
260 aa  77  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3279  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.59 
 
 
298 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0040  ParaA family ATPase  25.42 
 
 
288 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00514136  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3469  chromosome segregation ATPase  28.11 
 
 
264 aa  76.6  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3782  chromosome segregation ATPase  32.84 
 
 
257 aa  77  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000230675 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0054  chromosome segregation ATPase  33.33 
 
 
256 aa  77  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2798  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.78 
 
 
262 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.519748  normal  0.161878 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.34 
 
 
254 aa  76.6  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.2767899999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5789  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.7 
 
 
278 aa  76.3  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>