More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4267 on replicon NC_009431
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009431  Rsph17025_4267  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3961  ABC transporter related  76.89 
 
 
252 aa  362  4e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3222  ABC ferric siderophore transporter, ATPase subunit  76.49 
 
 
252 aa  360  1e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.286005  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1008  ABC transporter related  53.63 
 
 
252 aa  270  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3800  ABC transporter related  49.8 
 
 
252 aa  270  1e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0297  ABC transporter related  54.18 
 
 
252 aa  271  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3784  ABC transporter related  50.42 
 
 
253 aa  265  5.999999999999999e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2038  ABC transporter related protein  47.01 
 
 
252 aa  262  3e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34430  ABC-type enterochelin transport system, ATPase component  51.43 
 
 
252 aa  262  4e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1766  ABC transporter related  46.61 
 
 
252 aa  260  1e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0708561  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0678  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  47.81 
 
 
252 aa  260  2e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0361  ABC transporter-related protein  42.06 
 
 
252 aa  259  2e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4399  ABC transporter related  50.6 
 
 
252 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0635  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  47.81 
 
 
252 aa  257  1e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2369  ABC transporter related  48.16 
 
 
252 aa  256  3e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.068232 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0018  ABC transporter-like protein  48.81 
 
 
252 aa  256  4e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2401  ABC transporter related  51 
 
 
252 aa  254  9e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0997446  hitchhiker  0.000308014 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4147  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  43.82 
 
 
252 aa  254  1.0000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.045067  normal  0.0104969 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5025  ABC transporter related protein  56.73 
 
 
252 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383932  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0068  ABC transporter related  43.82 
 
 
252 aa  254  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4095  iron chelate ABC transporter, ATP-binding protein  43.43 
 
 
252 aa  252  4.0000000000000004e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0658  ABC transporter related  45.38 
 
 
253 aa  246  3e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1910  ABC transporter related  45.85 
 
 
256 aa  244  9.999999999999999e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.115927 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04610  ABC-type enterochelin transport system, ATPase component  49 
 
 
253 aa  241  6e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.280453 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1114  iron chelate ABC transporter, ATP-binding protein  43.82 
 
 
252 aa  241  6e-63  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2624  ABC transporter related  49.8 
 
 
252 aa  240  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1396  ABC transporter related protein  48.61 
 
 
252 aa  238  1e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.471533  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3341  ABC transporter related  48.12 
 
 
260 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000683738  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1543  enterochelin ABC transporter, ATP-binding protein  38 
 
 
251 aa  235  6e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3468  ABC transporter related  47.7 
 
 
260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1929  ABC transporter related  43.43 
 
 
252 aa  233  2.0000000000000002e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.284313  normal  0.0400988 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1353  enterochelin ABC transporter, ATP-binding protein  38.4 
 
 
251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3705  ABC transporter related  48.21 
 
 
251 aa  229  3e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252984  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16570  ABC-type enterochelin transport system, ATPase component  45.42 
 
 
251 aa  228  6e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0733  ABC transporter related  38.49 
 
 
252 aa  228  8e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5223  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  42.8 
 
 
250 aa  227  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4915  ABC transporter related  43.93 
 
 
250 aa  227  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25320  ABC-type enterochelin transport system, ATPase component  48.5 
 
 
251 aa  228  1e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06132  iron(III) ABC transporter ATP-binding protein  38.25 
 
 
251 aa  227  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0010  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  44.35 
 
 
250 aa  227  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1008  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.75 
 
 
253 aa  226  3e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000200517  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000329  ferric vibriobactin enterobactin transport system ATP-binding protein  38.65 
 
 
251 aa  225  5.0000000000000005e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000365879  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5231  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  43.51 
 
 
250 aa  224  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5244  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  42.4 
 
 
250 aa  224  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2913  ABC transporter related  45.6 
 
 
250 aa  224  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000412877  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4949  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  42.4 
 
 
250 aa  223  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.957601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4792  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  42.4 
 
 
250 aa  223  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.153192  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4812  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  42.4 
 
 
250 aa  223  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5327  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  42.4 
 
 
250 aa  223  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.502609  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5194  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  42.4 
 
 
250 aa  223  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3667  ABC transporter related  45.19 
 
 
260 aa  219  3e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2666  ABC transporter related protein  47.9 
 
 
263 aa  218  6e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30510  ABC-type enterochelin transport system, ATPase component  46.12 
 
 
254 aa  218  1e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2660  ABC transporter related  43.1 
 
 
250 aa  217  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0998  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, ATP-binding protein  39.6 
 
 
254 aa  217  1e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000010903  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0759  ABC transporter related  38.02 
 
 
253 aa  215  5.9999999999999996e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0776  ABC transporter related  38.02 
 
 
253 aa  215  5.9999999999999996e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.166423  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1627  ABC transporter related  43.51 
 
 
253 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0402  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.65 
 
 
259 aa  213  2.9999999999999995e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2592  ferric siderophore ABC transporter, ATP-binding protein  47.35 
 
 
258 aa  210  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1026  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  40.4 
 
 
251 aa  207  1e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0106643  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0637  ABC transporter related  36.25 
 
 
251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0302284  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1737  ABC transporter related  45.08 
 
 
284 aa  196  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0324533  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5174  ABC transporter related  39.92 
 
 
270 aa  195  6e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3902  ABC transporter-related protein  39.92 
 
 
270 aa  194  8.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2702  ABC transporter related  43.33 
 
 
290 aa  194  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5504  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.5 
 
 
270 aa  193  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5061  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.5 
 
 
270 aa  193  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0333  ABC transporter related  46.22 
 
 
282 aa  193  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5078  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.5 
 
 
270 aa  193  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5447  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.5 
 
 
270 aa  193  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.753542  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5473  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.5 
 
 
270 aa  193  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5510  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.5 
 
 
270 aa  192  4e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5230  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  39.5 
 
 
270 aa  192  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5629  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  39.5 
 
 
270 aa  192  4e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5559  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.5 
 
 
270 aa  192  4e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2061  ABC transporter related  41.56 
 
 
277 aa  189  2.9999999999999997e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.948125 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  35.86 
 
 
256 aa  186  2e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  41.6 
 
 
268 aa  186  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1621  ABC transporter-like protein  43.35 
 
 
266 aa  186  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.76125  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0685  ABC transporter related  35.66 
 
 
265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0670  ABC transporter related  35.66 
 
 
265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3299  ABC transporter related  42.08 
 
 
265 aa  183  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.971669  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1050  ABC transporter related protein  40.83 
 
 
263 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0306  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.86 
 
 
265 aa  183  3e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0418  protein of unknown function DUF105  40.48 
 
 
490 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0810  putative ferrichrome ABC transporter, ATP-binding protein  37.01 
 
 
260 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.024008  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50330  iron(III)-siderophore ABC transporter ATP-binding protein  43.14 
 
 
255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.219188  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1814  ABC transporter related  39.17 
 
 
275 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0797  ferrichrome ABC transporter ATP-binding protein  36.61 
 
 
260 aa  182  6e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.274021  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1120  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  40.16 
 
 
266 aa  181  7e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.721216  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1448  ABC transporter related protein  42.97 
 
 
264 aa  181  9.000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.425565  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3756  ABC transporter related protein  40.56 
 
 
274 aa  181  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1929  ABC Fe+3 siderophore/cobalamin transporter, ATPase subunit  42.23 
 
 
295 aa  180  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.051174  normal  0.251825 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2583  ABC transporter related protein  44.54 
 
 
293 aa  180  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04153  iron-dicitrate transporter subunit  40.08 
 
 
255 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3713  ABC transporter related protein  40.08 
 
 
255 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04116  hypothetical protein  40.08 
 
 
255 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4864  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  40.08 
 
 
255 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0739  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  40.08 
 
 
255 aa  178  5.999999999999999e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>