More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2592 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2592  ferric siderophore ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 258 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1627  ABC transporter related  68.65 
 
 		 253 aa  367  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3341  ABC transporter related  65.87 
 
 		 260 aa  347  1e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000683738  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3468  ABC transporter related  65.48 
 
 		 260 aa  347  1e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3667  ABC transporter related  64.68 
 
 		 260 aa  346  3e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0361  ABC transporter-related protein  49 
 
 		 252 aa  278  8e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0998  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, ATP-binding protein  49.41 
 
 		 254 aa  260  2e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000010903  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000329  ferric vibriobactin enterobactin transport system ATP-binding protein  47.6 
 
 		 251 aa  258  5.0000000000000005e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000365879  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06132  iron(III) ABC transporter ATP-binding protein  47.6 
 
 		 251 aa  257  1e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3784  ABC transporter related  51 
 
 		 253 aa  254  7e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0733  ABC transporter related  43.82 
 
 		 252 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1353  enterochelin ABC transporter, ATP-binding protein  43.43 
 
 		 251 aa  251  8.000000000000001e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34430  ABC-type enterochelin transport system, ATPase component  51 
 
 		 252 aa  249  2e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1543  enterochelin ABC transporter, ATP-binding protein  42.63 
 
 		 251 aa  249  2e-65  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2401  ABC transporter related  54.39 
 
 		 252 aa  249  3e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0997446  hitchhiker  0.000308014 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0018  ABC transporter-like protein  49 
 
 		 252 aa  249  4e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1766  ABC transporter related  47.81 
 
 		 252 aa  248  6e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0708561  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0297  ABC transporter related  51.98 
 
 		 252 aa  248  6e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2666  ABC transporter related protein  52.4 
 
 		 263 aa  246  2e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2038  ABC transporter related protein  46.61 
 
 		 252 aa  246  4e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0759  ABC transporter related  45.02 
 
 		 253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0776  ABC transporter related  45.02 
 
 		 253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.166423  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0068  ABC transporter related  47.01 
 
 		 252 aa  241  6e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4147  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  47.01 
 
 		 252 aa  241  6e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.045067  normal  0.0104969 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4095  iron chelate ABC transporter, ATP-binding protein  46.61 
 
 		 252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0402  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  43.48 
 
 		 259 aa  238  5.999999999999999e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0678  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  47.01 
 
 		 252 aa  238  9e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1008  ABC transporter related  48.02 
 
 		 252 aa  237  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1114  iron chelate ABC transporter, ATP-binding protein  47.64 
 
 		 252 aa  237  2e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04610  ABC-type enterochelin transport system, ATPase component  48.62 
 
 		 253 aa  235  5.0000000000000005e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.280453 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1396  ABC transporter related protein  49.37 
 
 		 252 aa  235  7e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.471533  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0635  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  46.61 
 
 		 252 aa  234  7e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1008  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  45.11 
 
 		 253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000200517  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3800  ABC transporter related  47.01 
 
 		 252 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0637  ABC transporter related  44.4 
 
 		 251 aa  232  4.0000000000000004e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0302284  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2369  ABC transporter related  45.63 
 
 		 252 aa  231  1e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.068232 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25320  ABC-type enterochelin transport system, ATPase component  47.81 
 
 		 251 aa  229  3e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5231  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  46 
 
 		 250 aa  226  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0010  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  46 
 
 		 250 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5244  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  46 
 
 		 250 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4915  ABC transporter related  45.6 
 
 		 250 aa  225  6e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5223  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  46 
 
 		 250 aa  224  9e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4949  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  46 
 
 		 250 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.957601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4792  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  46 
 
 		 250 aa  224  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.153192  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5194  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  46 
 
 		 250 aa  224  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4812  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  46 
 
 		 250 aa  224  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5327  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  46 
 
 		 250 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.502609  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30510  ABC-type enterochelin transport system, ATPase component  47.24 
 
 		 254 aa  223  2e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2913  ABC transporter related  45.6 
 
 		 250 aa  223  3e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000412877  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5025  ABC transporter related protein  50.41 
 
 		 252 aa  221  8e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383932  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2660  ABC transporter related  44 
 
 		 250 aa  219  1.9999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1929  ABC transporter related  43.25 
 
 		 252 aa  219  3.9999999999999997e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.284313  normal  0.0400988 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16570  ABC-type enterochelin transport system, ATPase component  45.02 
 
 		 251 aa  218  6e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1026  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  43.6 
 
 		 251 aa  217  2e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0106643  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3705  ABC transporter related  48 
 
 		 251 aa  217  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252984  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4267  hypothetical protein  47.35 
 
 		 252 aa  210  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3961  ABC transporter related  48.54 
 
 		 252 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3222  ABC ferric siderophore transporter, ATPase subunit  48.54 
 
 		 252 aa  204  9e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.286005  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4263  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  40.78 
 
 		 272 aa  201  9e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4447  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40.78 
 
 		 272 aa  201  9e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4595  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  40.78 
 
 		 272 aa  201  9e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4100  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40.78 
 
 		 272 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4111  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40.78 
 
 		 272 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0797  ferrichrome ABC transporter ATP-binding protein  37.65 
 
 		 260 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.274021  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0810  putative ferrichrome ABC transporter, ATP-binding protein  38.33 
 
 		 260 aa  199  5e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.024008  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4448  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40.78 
 
 		 272 aa  198  7e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0685  ABC transporter related  40.25 
 
 		 265 aa  196  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0670  ABC transporter related  40.25 
 
 		 265 aa  196  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0306  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40.79 
 
 		 265 aa  196  3e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4500  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  41.49 
 
 		 272 aa  196  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4486  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.61 
 
 		 272 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0750  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.61 
 
 		 272 aa  195  7e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4214  ABC transporter related  39.22 
 
 		 272 aa  194  9e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4399  ABC transporter related  43.09 
 
 		 252 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  38.93 
 
 		 268 aa  191  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  37.14 
 
 		 268 aa  191  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0658  ABC transporter related  42.98 
 
 		 253 aa  191  1e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0691  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  43.42 
 
 		 265 aa  189  5e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1910  ABC transporter related  40.96 
 
 		 256 aa  187  2e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.115927 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3451  ABC transporter related protein  42.98 
 
 		 265 aa  186  3e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0148611  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0156  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  42.98 
 
 		 265 aa  186  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00150  iron-hydroxamate transporter subunit  42.98 
 
 		 265 aa  186  4e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00128613  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0161  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  42.98 
 
 		 265 aa  186  4e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0155  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  42.98 
 
 		 265 aa  186  4e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00149  hypothetical protein  42.98 
 
 		 265 aa  186  4e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00123723  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3508  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  42.98 
 
 		 265 aa  185  5e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000160242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0143  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  42.98 
 
 		 265 aa  185  7e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4668  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.64 
 
 		 256 aa  185  8e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0163  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  42.54 
 
 		 265 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2076  ABC transporter related  38.1 
 
 		 319 aa  182  3e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000611241 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26520  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  40.66 
 
 		 625 aa  182  4.0000000000000006e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0209  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  42.54 
 
 		 265 aa  181  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0225  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  42.54 
 
 		 265 aa  181  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0221  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  42.54 
 
 		 265 aa  181  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3503  ABC transporter related  36.97 
 
 		 273 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0210  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  42.54 
 
 		 265 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0584  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.19 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0228  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  42.54 
 
 		 265 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2188  ABC transporter related  39.68 
 
 		 257 aa  181  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3768  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.97 
 
 		 273 aa  180  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>