57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3667 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3667  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  349  1e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.290827  normal  0.787143 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3827  hypothetical protein  83.53 
 
 		 170 aa  250  6e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.78759  normal  0.497757 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3100  hypothetical protein  83.53 
 
 		 170 aa  249  2e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0158  hypothetical protein  36.54 
 
 		 164 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3847  hypothetical protein  35.26 
 
 		 164 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0562  hypothetical protein  36.13 
 
 		 168 aa  80.1  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2264  hypothetical protein  37.69 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.124319  normal  0.0478819 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11150  hypothetical protein  34.25 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2312  hypothetical protein  29.9 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.152747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0228  hypothetical protein  31.48 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0431  hypothetical protein  34.23 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111877 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0398  hypothetical protein  39.8 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.85997  normal  0.904592 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2834  hypothetical protein  29.94 
 
 		 150 aa  57  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.16936 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2413  hypothetical protein  27.34 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0702  hypothetical protein  32.11 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0474  hypothetical protein  33.03 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0881  hypothetical protein  28.36 
 
 		 141 aa  54.3  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.569107  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0547  hypothetical protein  29.08 
 
 		 142 aa  53.1  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5103  hypothetical protein  31.48 
 
 		 142 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.605175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46050  hypothetical protein  33.94 
 
 		 142 aa  50.4  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0689  hypothetical protein  28.7 
 
 		 140 aa  50.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.885793  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3934  hypothetical protein  31.43 
 
 		 142 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3754  hypothetical protein  30.39 
 
 		 184 aa  49.3  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0104  hypothetical protein  29.73 
 
 		 187 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.805138  normal  0.943991 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0107  hypothetical protein  29.73 
 
 		 187 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3722  hypothetical protein  31.43 
 
 		 136 aa  48.5  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2765  hypothetical protein  29.73 
 
 		 194 aa  47  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0849  hypothetical protein  28.85 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0214356 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2084  hypothetical protein  29.91 
 
 		 139 aa  45.8  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0349  hypothetical protein  36.84 
 
 		 136 aa  45.1  0.0005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0802  hypothetical protein  31.43 
 
 		 140 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.994643  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4270  hypothetical protein  27.93 
 
 		 197 aa  44.7  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01473  predicted membrane protein i A1501  26.56 
 
 		 130 aa  44.7  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0646  hypothetical protein  29.35 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.191935  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1468  hypothetical protein  26.81 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200067  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08831  hypothetical protein  31.31 
 
 		 186 aa  43.9  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.152227  hitchhiker  0.0000304653 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0112  hypothetical membrane spanning protein  28.97 
 
 		 139 aa  43.9  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0464  hypothetical protein  28.06 
 
 		 141 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424113 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14931  hypothetical protein  35.35 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08470  hypothetical protein  29.52 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000178452 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0461  hypothetical protein  28.06 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335384  normal  0.121945 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4772  hypothetical protein  27.33 
 
 		 141 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.338274  normal  0.685574 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3568  hypothetical protein  27.54 
 
 		 143 aa  43.5  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0558336  normal  0.555029 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3443  hypothetical protein  29.59 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.879523 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1890  hypothetical protein  34.78 
 
 		 143 aa  42.7  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0603  hypothetical protein  28.83 
 
 		 142 aa  42.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2844  hypothetical protein  26.61 
 
 		 149 aa  42.7  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0591759 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3301  hypothetical protein  29.47 
 
 		 143 aa  42.7  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0835749  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4570  hypothetical protein  28.83 
 
 		 142 aa  42  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0431  hypothetical protein  28.57 
 
 		 141 aa  42  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.383973 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09781  hypothetical protein  22.95 
 
 		 188 aa  42  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.711198  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0919  hypothetical protein  25.49 
 
 		 188 aa  41.6  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.113823  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1490  hypothetical protein  31.53 
 
 		 140 aa  41.6  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09801  hypothetical protein  25.49 
 
 		 188 aa  41.2  0.007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3572  hypothetical protein  30.3 
 
 		 175 aa  41.2  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1259  hypothetical protein  26.97 
 
 		 148 aa  41.2  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1493  hypothetical protein  31.53 
 
 		 140 aa  40.8  0.01  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>