12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3230 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3230  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.760608 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3329  hypothetical protein  81.82 
 
 		 242 aa  278  5e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.494353  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4055  hypothetical protein  82.89 
 
 		 229 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.591615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0710  hypothetical protein  48.57 
 
 		 215 aa  157  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1806  hypothetical protein  46.34 
 
 		 275 aa  139  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0349217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6517  hypothetical protein  47.56 
 
 		 270 aa  136  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2472  hypothetical protein  42.77 
 
 		 280 aa  129  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1288  hypothetical protein  31.93 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.266052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0531  hypothetical protein  34.66 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0475766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3221  hypothetical protein  32.62 
 
 		 228 aa  48.1  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359488 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3229  hypothetical protein  27.5 
 
 		 214 aa  46.6  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.892596  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0263  Protein of unknown function DUF2306, membrane  36.36 
 
 		 238 aa  45.4  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.650888 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>