More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2248 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3762  elongation factor G  49.02 
 
 		 681 aa  662    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0675022 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3294  elongation factor G  50.08 
 
 		 680 aa  639    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2247  elongation factor G  89.67 
 
 		 669 aa  1240    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.040202  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0922  elongation factor G  89.79 
 
 		 667 aa  1238    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.122297  normal  0.0871733 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1140  elongation factor G  52.54 
 
 		 671 aa  711    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1634  elongation factor G  48.87 
 
 		 675 aa  640    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.100311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2248  elongation factor G  100 
 
 		 670 aa  1358    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.456219 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0279  small GTP-binding protein  48.88 
 
 		 676 aa  620  1e-176  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1336  elongation factor G  46.81 
 
 		 678 aa  621  1e-176  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2771  elongation factor G  46.35 
 
 		 688 aa  618  1e-176  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.252482  normal  0.08809 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1365  elongation factor G  46.81 
 
 		 678 aa  621  1e-176  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0359186 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1300  elongation factor G  47.84 
 
 		 688 aa  610  1e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.196732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4806  elongation factor G  47.62 
 
 		 683 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1106  elongation factor G  47.09 
 
 		 699 aa  606  9.999999999999999e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.67028  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2978  elongation factor G  46.81 
 
 		 696 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.493994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4119  elongation factor G  47.41 
 
 		 682 aa  605  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.390379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5941  elongation factor G  47.48 
 
 		 678 aa  600  1e-170  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0130672  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3921  elongation factor G  47.05 
 
 		 683 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5234  elongation factor G  47.75 
 
 		 678 aa  596  1e-169  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00485318 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1805  elongation factor G  46.47 
 
 		 655 aa  581  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.504417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2110  elongation factor G  46.56 
 
 		 671 aa  570  1e-161  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1818  elongation factor G  45.72 
 
 		 642 aa  567  1e-160  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237158 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1277  elongation factor G  45.48 
 
 		 686 aa  563  1.0000000000000001e-159  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.836232  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2751  elongation factor G  47.12 
 
 		 661 aa  533  1e-150  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2082  elongation factor G  44.87 
 
 		 662 aa  525  1e-147  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0399925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0543  elongation factor G  42.62 
 
 		 660 aa  511  1e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.934068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4086  elongation factor G  36.73 
 
 		 653 aa  433  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.639909 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5899  elongation factor G  36.84 
 
 		 653 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  30.72 
 
 		 692 aa  358  9.999999999999999e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  32.99 
 
 		 692 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1660  translation elongation factor G  33.62 
 
 		 691 aa  357  3.9999999999999996e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00040628  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  32.56 
 
 		 695 aa  355  2e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3663  translation elongation factor G  34.06 
 
 		 690 aa  352  1e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132269 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2741  elongation factor G  33.82 
 
 		 686 aa  349  9e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.784554  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1785  elongation factor G  33.48 
 
 		 687 aa  348  2e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0096  elongation factor G  29.26 
 
 		 696 aa  347  4e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0074  elongation factor G  29.15 
 
 		 696 aa  347  5e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  31.74 
 
 		 695 aa  347  6e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2909  elongation factor G  33.48 
 
 		 686 aa  346  1e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1905  elongation factor G  33.14 
 
 		 701 aa  342  1e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.129196 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2972  translation elongation factor G  32.21 
 
 		 673 aa  340  4e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2931  elongation factor G  34.11 
 
 		 688 aa  340  4e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.400395 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  32.55 
 
 		 701 aa  339  8e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  31.51 
 
 		 691 aa  337  5.999999999999999e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2318  small GTP-binding protein domain-containing protein  32.99 
 
 		 682 aa  336  7e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1831  elongation factor G  29.67 
 
 		 694 aa  335  2e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000276436  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  33.48 
 
 		 680 aa  333  4e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1937  elongation factor G  33.33 
 
 		 685 aa  331  3e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  30.88 
 
 		 691 aa  330  7e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1367  translation elongation factor G  31.11 
 
 		 670 aa  328  3e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560984 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  31 
 
 		 694 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1045  translation elongation factor G  32.54 
 
 		 696 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1229  translation elongation factor G  30.48 
 
 		 673 aa  325  2e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0505633  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0204  small GTP-binding protein  30.53 
 
 		 682 aa  323  7e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153237  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1113  translation elongation factor G  31.51 
 
 		 696 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.862086  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  30.74 
 
 		 689 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000306199  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  30.96 
 
 		 689 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  30.38 
 
 		 679 aa  321  3e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1140  translation elongation factor G  31.38 
 
 		 683 aa  320  7e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.128625  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  31.8 
 
 		 692 aa  318  2e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2103  elongation factor G  32.8 
 
 		 688 aa  318  2e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0356  elongation factor G  30.78 
 
 		 691 aa  317  3e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0947  translation elongation factor G, putative  31.54 
 
 		 692 aa  317  6e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.200709  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1141  elongation factor G  31.91 
 
 		 691 aa  316  7e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000161111  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  30.37 
 
 		 692 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0717  small GTP-binding protein  28.86 
 
 		 696 aa  315  9.999999999999999e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  30.37 
 
 		 692 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  30.88 
 
 		 697 aa  315  1.9999999999999998e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  30.22 
 
 		 692 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0879  small GTP-binding protein  30.61 
 
 		 690 aa  314  2.9999999999999996e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.323736  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  30.22 
 
 		 692 aa  314  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2537  small GTP-binding protein  30.38 
 
 		 697 aa  313  3.9999999999999997e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0128296  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  30.22 
 
 		 692 aa  314  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000590247  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0119  elongation factor G  30.22 
 
 		 692 aa  314  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.92544e-59 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  30.31 
 
 		 691 aa  313  4.999999999999999e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  30.22 
 
 		 692 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  30.22 
 
 		 692 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1973  elongation factor G  30.96 
 
 		 690 aa  313  4.999999999999999e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  30.22 
 
 		 692 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09730  translation elongation factor G  30.13 
 
 		 688 aa  313  6.999999999999999e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1289  translation elongation factor G  30.71 
 
 		 685 aa  313  7.999999999999999e-84  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1905  elongation factor G  30.72 
 
 		 691 aa  313  7.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.224995  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2159  elongation factor G  30.92 
 
 		 691 aa  313  9e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.894134 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2437  elongation factor G  30.92 
 
 		 691 aa  313  9e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.281636  normal  0.318497 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  30.07 
 
 		 692 aa  313  9e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0656  elongation factor G  30.22 
 
 		 694 aa  313  9e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  30.07 
 
 		 692 aa  312  1e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000176822  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1188  elongation factor G  31.39 
 
 		 701 aa  312  1e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5198  elongation factor G  30.07 
 
 		 692 aa  312  1e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000109677  unclonable  1.5030900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1985  elongation factor G  29.91 
 
 		 697 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.786263  normal  0.270154 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1486  elongation factor G  31.05 
 
 		 695 aa  311  2.9999999999999997e-83  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000303107  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2120  elongation factor G  30.78 
 
 		 691 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.584312  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2215  elongation factor G  30.49 
 
 		 691 aa  310  4e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0124  translation elongation factor G  30.89 
 
 		 707 aa  310  5e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  30.97 
 
 		 692 aa  309  1.0000000000000001e-82  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1178  translation elongation factor G  30.54 
 
 		 683 aa  309  1.0000000000000001e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.747201  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1676  elongation factor G  31.01 
 
 		 691 aa  308  1.0000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377788  hitchhiker  0.000311159 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  30.33 
 
 		 692 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1311  elongation factor G  31.28 
 
 		 691 aa  309  1.0000000000000001e-82  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000260019  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2622  translation elongation factor G  31.23 
 
 		 697 aa  309  1.0000000000000001e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000402697  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>