More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2071 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2722  cysteinyl-tRNA synthetase  71.88 
 
 		 499 aa  660    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2071  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 486 aa  995    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.377072 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1380  cysteinyl-tRNA synthetase  94.03 
 
 		 486 aa  914    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.194262  normal  0.461821 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4063  cysteinyl-tRNA synthetase  69.83 
 
 		 462 aa  633  1e-180  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.824791  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1698  cysteinyl-tRNA synthetase  64.24 
 
 		 458 aa  605  9.999999999999999e-173  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0508946  normal  0.0729596 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1153  cysteinyl-tRNA synthetase  63.15 
 
 		 457 aa  584  1e-166  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.102155  normal  0.0430142 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1958  cysteinyl-tRNA synthetase  57 
 
 		 453 aa  511  1e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.46476  normal  0.773483 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0135  cysteinyl-tRNA synthetase  54.51 
 
 		 449 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0689  cysteinyl-tRNA synthetase  54.24 
 
 		 459 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0435653  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1488  cysteinyl-tRNA synthetase  53.51 
 
 		 482 aa  467  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.335509  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4717  cysteinyl-tRNA synthetase  52.26 
 
 		 462 aa  458  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0419  cysteinyl-tRNA synthetase  50.94 
 
 		 453 aa  456  1e-127  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0310723 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1915  cysteinyl-tRNA synthetase  52.3 
 
 		 458 aa  448  1e-125  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3374  cysteinyl-tRNA synthetase  51.45 
 
 		 493 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.301866  normal  0.0269367 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3498  cysteinyl-tRNA synthetase  51.99 
 
 		 472 aa  444  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2086  cysteinyl-tRNA synthetase  52 
 
 		 488 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.634388  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  51.68 
 
 		 463 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.680985  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1404  cysteinyl-tRNA synthetase  52.32 
 
 		 449 aa  435  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0713  cysteinyl-tRNA synthetase  52.83 
 
 		 466 aa  435  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.652412 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1228  cysteinyl-tRNA synthetase  49.8 
 
 		 477 aa  435  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2208  cysteinyl-tRNA synthetase  49.8 
 
 		 491 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4529  cysteinyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 		 462 aa  431  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0386515 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1184  cysteinyl-tRNA synthetase  51.38 
 
 		 463 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.257527  normal  0.696826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1638  cysteinyl-tRNA synthetase  51.98 
 
 		 460 aa  429  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.2661  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1100  cysteinyl-tRNA synthetase  48.9 
 
 		 472 aa  430  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0132034 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0459  cysteinyl-tRNA synthetase  51.77 
 
 		 460 aa  426  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0171748 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0965  cysteinyl-tRNA synthetase  48.49 
 
 		 506 aa  422  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.910557  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5285  cysteinyl-tRNA synthetase  51.98 
 
 		 462 aa  425  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.693404  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5212  cysteinyl-tRNA synthetase  50.52 
 
 		 462 aa  418  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.253411 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0676  cysteinyl-tRNA synthetase  49.79 
 
 		 474 aa  419  1e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.02633 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00355  cysteinyl-tRNA synthetase  50.92 
 
 		 474 aa  421  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.229746  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2398  cysteinyl-tRNA synthetase  48.15 
 
 		 461 aa  419  1e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0149  cysteinyl-tRNA synthetase  46.2 
 
 		 457 aa  416  9.999999999999999e-116  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5571  cysteinyl-tRNA synthetase  54.59 
 
 		 465 aa  413  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.719635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2665  cysteinyl-tRNA synthetase  50.62 
 
 		 468 aa  414  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4745  cysteinyl-tRNA synthetase  50.52 
 
 		 462 aa  411  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0768  cysteinyl-tRNA synthetase  45.15 
 
 		 459 aa  410  1e-113  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.202696  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1038  cysteinyl-tRNA synthetase  57.95 
 
 		 463 aa  412  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.238727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0281  cysteinyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 		 467 aa  409  1e-113  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0311  cysteinyl-tRNA synthetase  49.06 
 
 		 467 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  53.59 
 
 		 588 aa  406  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0677  cysteinyl-tRNA synthetase  48.65 
 
 		 506 aa  401  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0670  cysteinyl-tRNA synthetase  48.82 
 
 		 506 aa  400  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.438078  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0481  cysteinyl-tRNA synthetase  44.14 
 
 		 500 aa  399  9.999999999999999e-111  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0308  cysteinyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 		 459 aa  394  1e-108  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2731  cysteinyl-tRNA synthetase  48.63 
 
 		 458 aa  390  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2611  cysteinyl-tRNA synthetase  46.82 
 
 		 505 aa  389  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.536822  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1903  cysteinyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 		 459 aa  386  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  45.02 
 
 		 456 aa  377  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  45.33 
 
 		 485 aa  369  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  44.67 
 
 		 459 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  44.47 
 
 		 459 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 		 461 aa  365  1e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  44.67 
 
 		 459 aa  364  2e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  44.67 
 
 		 459 aa  364  2e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 459 aa  363  4e-99  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  44.26 
 
 		 459 aa  362  1e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 		 459 aa  361  1e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 		 461 aa  362  1e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 		 459 aa  361  2e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1084  cysteinyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 		 454 aa  360  3e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.462524  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 		 461 aa  360  3e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 		 461 aa  360  3e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 460 aa  359  6e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 463 aa  358  9e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 459 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 		 465 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 		 461 aa  357  1.9999999999999998e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  45.13 
 
 		 455 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 459 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 459 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  45.02 
 
 		 460 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 		 459 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  44.47 
 
 		 461 aa  357  2.9999999999999997e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  44.47 
 
 		 461 aa  357  2.9999999999999997e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 		 460 aa  356  5.999999999999999e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  43.65 
 
 		 459 aa  356  5.999999999999999e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 		 459 aa  355  1e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0170  cysteinyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 		 466 aa  353  5e-96  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.183538  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2599  cysteinyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 		 460 aa  353  5e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00582653  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 		 466 aa  352  1e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2865  cysteinyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 		 462 aa  352  1e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2507  cysteinyl-tRNA synthetase  43.58 
 
 		 461 aa  351  2e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0635  cysteinyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 		 457 aa  351  2e-95  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1902  cysteinyl-tRNA synthetase  44.51 
 
 		 454 aa  350  3e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.478316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  40.28 
 
 		 470 aa  350  3e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0919  cysteinyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 		 456 aa  349  5e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  39.14 
 
 		 466 aa  349  6e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1122  cysteinyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 		 462 aa  349  6e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189583  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0552  cysteinyl-tRNA synthetase  39.14 
 
 		 466 aa  349  6e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 493 aa  349  6e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 		 485 aa  349  8e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 		 468 aa  349  8e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 		 485 aa  348  1e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2456  cysteinyl-tRNA synthetase  45.03 
 
 		 474 aa  347  3e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1940  cysteinyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 		 462 aa  347  3e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 		 468 aa  347  3e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2184  cysteinyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 461 aa  347  3e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  40.15 
 
 		 500 aa  346  4e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  43.91 
 
 		 485 aa  346  6e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>