35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3633 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3633  thiamine monophosphate synthase  100 
 
 		 272 aa  499  1e-140  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1284  thiamine monophosphate synthase  40.4 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2953  thiamine monophosphate synthase  29.81 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  38.78 
 
 		 313 aa  55.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  32.65 
 
 		 314 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2053  thiamine monophosphate synthase  39.04 
 
 		 169 aa  55.5  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0504215  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  33 
 
 		 316 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  37 
 
 		 315 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0306  hypothetical protein  30.07 
 
 		 321 aa  52.8  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  33 
 
 		 316 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  36 
 
 		 315 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5033  thiamine monophosphate synthase  32.51 
 
 		 201 aa  51.2  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.519144 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2025  mutator MutT protein  30.28 
 
 		 322 aa  50.1  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.153674  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2189  thiamine monophosphate synthase  37 
 
 		 315 aa  49.7  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.988337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  34 
 
 		 314 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2855  thiamine monophosphate synthase  32.99 
 
 		 178 aa  48.9  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0770384  normal  0.045909 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1173  Thiamine-phosphate diphosphorylase  27.34 
 
 		 185 aa  48.5  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0984  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase protein  31.74 
 
 		 198 aa  48.5  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.462651 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  34.41 
 
 		 325 aa  48.9  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2179  hypothetical protein  27.2 
 
 		 314 aa  48.1  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299804  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  36.96 
 
 		 310 aa  47  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  32.73 
 
 		 314 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  31 
 
 		 314 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0858  hypothetical protein  34.34 
 
 		 317 aa  45.8  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  31 
 
 		 314 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2246  thiamine monophosphate synthase  37.11 
 
 		 194 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0548714 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4514  thiamine monophosphate synthase  37.89 
 
 		 194 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0934  hypothetical protein  32 
 
 		 313 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3677  thiamine monophosphate synthase  37.89 
 
 		 194 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.62971  normal  0.140239 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1996  NUDIX hydrolase  32.38 
 
 		 352 aa  44.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.42027  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3850  thiamine monophosphate synthase  37.89 
 
 		 194 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  34.13 
 
 		 317 aa  43.9  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0210  dGTP-pyrophosphohydrolase; thiamine phosphate synthase  34.58 
 
 		 212 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0218369  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  27.61 
 
 		 314 aa  42.7  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0405  hypothetical protein  42 
 
 		 320 aa  42  0.01  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>