194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2826 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2826  flagellar basal-body rod protein FlgB  100 
 
 		 152 aa  315  1e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2570  flagellar basal-body rod protein FlgB  36.96 
 
 		 142 aa  96.7  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5538  flagellar basal body rod protein FlgB  35.07 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.407776  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1366  flagellar basal body rod protein FlgB  32.12 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1132  flagellar basal body rod protein FlgB  35.88 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1693  flagellar basal body rod protein FlgB  32.35 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.235256  normal  0.633905 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5497  flagellar basal body rod protein FlgB  29.41 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0469396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4411  flagellar basal body rod protein FlgB  31.58 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420287  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5155  flagellar basal body rod protein FlgB  30.6 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18507  normal  0.0554322 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2608  flagellar basal body rod protein FlgB  33.82 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0696754  normal  0.269497 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1392  flagellar basal body rod protein FlgB  33.59 
 
 		 135 aa  70.1  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154079  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2831  flagellar basal body rod protein FlgB  33.82 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0664971  normal  0.159517 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2235  flagellar basal body rod protein FlgB  31.3 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2638  flagellar basal body rod protein FlgB  30.88 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.164325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3777  flagellar basal body rod protein FlgB  30.66 
 
 		 145 aa  67  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0109555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2110  flagellar basal body rod protein FlgB  32.03 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.132503 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1978  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.08 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0749  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.58 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0462  flagellar basal body rod protein FlgB  29.93 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0266  flagellar basal body rod protein FlgB  29.93 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3437  putative flagellar basal-body rod protein FlgB  29.92 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2176  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.1 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.873568  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3325  flagellar basal body rod protein FlgB  30.56 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1692  flagellar basal body rod protein FlgB  31.85 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.315615  normal  0.0176326 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6371  flagellar basal body rod protein FlgB  31.03 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.232984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0140  flagellar basal body rod protein FlgB  27.39 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.933867 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1938  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.08 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.276304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2994  flagellar basal body rod protein FlgB  30.56 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1217  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.41 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.284991  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2099  flagellar basal body rod protein FlgB  30.56 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0278  flagellar basal body rod protein FlgB  30.56 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3354  flagellar basal body rod protein FlgB  30.56 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2573  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.17 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.368531  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0926  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.62 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1196  flagellar basal body rod protein FlgB  32.17 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1094  flagellar basal body rod protein FlgB  31.01 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.376721 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1452  flagellar basal body rod protein FlgB  32.17 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156749 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0317  flagellar basal body rod protein FlgB  30 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.763946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4199  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.89 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3044  flagellar basal body rod protein FlgB  31.03 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2252  flagellar basal body rod protein FlgB  32.17 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1196  flagellar basal body rod protein FlgB  32.17 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1553  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.69 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.809609  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3794  flagellar basal body rod protein FlgB  28.03 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2527  flagellar basal body rod protein FlgB  32.17 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.30096  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2055  flagellar basal body rod protein FlgB  32.17 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.176072 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01069  flagellar basal-body rod protein B  32.17 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01077  hypothetical protein  32.17 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2970  flagellar basal body rod protein FlgB  29.13 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.281084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3020  flagellar basal body rod protein FlgB  31.51 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1587  flagellar basal body rod protein FlgB  27.27 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2935  flagellar basal body rod protein FlgB  31.03 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.529299 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3673  flagellar basal body rod protein FlgB  29.55 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1340  flagellar basal body rod protein FlgB  29.57 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3070  flagellar basal body rod protein FlgB  31.03 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16920  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.31 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1637  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.11 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2411  flagellar basal body rod protein FlgB  30.34 
 
 		 162 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374813  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3025  flagellar basal body rod protein FlgB  30.34 
 
 		 162 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0258442  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2198  flagellar basal body rod protein FlgB  27.87 
 
 		 138 aa  57  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000944408 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1108  flagellar basal body rod protein FlgB  29.13 
 
 		 130 aa  57  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00049744  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1271  flagellar basal body rod protein FlgB  27.87 
 
 		 138 aa  57  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0101569 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1242  flagellar basal body rod protein FlgB  27.87 
 
 		 138 aa  57  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.217975 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1286  flagellar basal body rod protein FlgB  27.87 
 
 		 138 aa  57  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.468061  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2014  flagellar basal body rod protein FlgB  27.87 
 
 		 138 aa  57  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1525  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.51 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0349  flagellar basal body rod protein FlgB  29.23 
 
 		 130 aa  57  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0740426 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2318  flagellar basal body rod protein FlgB  29.1 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0255  flagellar basal body rod protein FlgB  30 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2924  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.17 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0240  flagellar basal body rod protein FlgB  27.21 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2850  flagellar basal body rod protein FlgB  31.93 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.115651 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1331  flagellar basal body rod protein FlgB  29.37 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.754656  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1998  flagellar basal body rod protein FlgB  29.2 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2425  flagellar basal body rod protein FlgB  29.2 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.395558  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24000  flagellar basal-body rod protein  27.56 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2324  flagellar basal body rod protein FlgB  29.2 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2272  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.35 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.240352 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1776  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.35 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3651  flagellar basal body rod protein FlgB  29.91 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0237  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.43 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3583  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.36 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0676749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1868  flagellar basal body rod protein FlgB  27.05 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1144  flagellar basal body rod protein FlgB  29.23 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2598  flagellar basal body rod protein FlgB  27.97 
 
 		 138 aa  53.5  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.171228  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0069  flagellar basal body rod protein FlgB  32.17 
 
 		 116 aa  53.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3734  flagellar basal body rod protein FlgB  27.82 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2965  flagellar basal body rod protein FlgB  29.37 
 
 		 129 aa  53.5  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.157354 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2948  flagellar basal body rod protein FlgB  26.71 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0735  flagellar basal body rod protein FlgB  25.19 
 
 		 130 aa  53.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2134  flagellar basal body protein-like protein  31.5 
 
 		 126 aa  53.5  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1768  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.34 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.144654  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2054  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.51 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2992  flagellar basal body rod protein FlgB  28.57 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1645  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.83 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000413162  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0618  flagellar basal body rod protein FlgB  28.91 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0896138  normal  0.0941281 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2000  flagellar basal body rod protein FlgB  28.33 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0629  flagellar basal body rod protein FlgB  28.91 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0365  flagellar basal body rod protein FlgB  29.93 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1517  flagellar basal body rod protein FlgB  29.41 
 
 		 136 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0183705  normal  0.774595 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>