42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_5003 on replicon NC_012855
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012855  Rpic12D_5003  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  357  5e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.468369 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6789  hypothetical protein  63.92 
 
 		 161 aa  201  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5873  hypothetical protein  51.7 
 
 		 168 aa  146  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.133238 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5219  hypothetical protein  50.34 
 
 		 180 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60590  hypothetical protein  51.02 
 
 		 184 aa  141  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2401  hypothetical protein  51.37 
 
 		 192 aa  135  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.135537 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0008  hypothetical protein  47.55 
 
 		 183 aa  135  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4523  hypothetical protein  49.32 
 
 		 189 aa  134  6.0000000000000005e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.584646 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0151  hypothetical protein  46.21 
 
 		 197 aa  133  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5761  hypothetical protein  47.55 
 
 		 193 aa  132  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000051993 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3136  hypothetical protein  44.9 
 
 		 165 aa  130  7.999999999999999e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0152  hypothetical protein  44.76 
 
 		 183 aa  128  3e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0120146  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2006  hypothetical protein  44.22 
 
 		 287 aa  127  1.0000000000000001e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.436059  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1821  hypothetical protein  45.52 
 
 		 182 aa  124  8.000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.758753  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2199  hypothetical protein  47.86 
 
 		 184 aa  123  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.163622  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3361  hypothetical protein  46.32 
 
 		 187 aa  123  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.09095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3505  hypothetical protein  47.92 
 
 		 173 aa  122  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.42017  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2927  hypothetical protein  44.23 
 
 		 201 aa  121  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0506294  normal  0.0176003 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0365  hypothetical protein  40 
 
 		 263 aa  120  8e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0750  hypothetical protein  41.26 
 
 		 175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248432  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0074  hypothetical protein  39.75 
 
 		 182 aa  117  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2022  hypothetical protein  42.14 
 
 		 286 aa  109  2.0000000000000002e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00213305  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2783  hypothetical protein  47.06 
 
 		 114 aa  86.7  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0000000347405  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06052  conserved hypothetical protein  33.94 
 
 		 732 aa  72.8  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1970  hypothetical protein  50.77 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.611932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000986  uncharacterized domain/GTP cyclohydrolase II  34.75 
 
 		 353 aa  59.3  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2448  hypothetical protein  31.21 
 
 		 146 aa  57  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1431  hypothetical protein  30.99 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.130187  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3165  hypothetical protein  28.1 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2797  hypothetical protein  28.66 
 
 		 150 aa  52.8  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.744208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07041  hypothetical protein  32.2 
 
 		 164 aa  51.2  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0354  hypothetical protein  28.21 
 
 		 148 aa  50.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000171392  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1897  hypothetical protein  28.29 
 
 		 157 aa  50.1  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0270  hypothetical protein  25.64 
 
 		 157 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677549 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2289  hypothetical protein  25.61 
 
 		 157 aa  48.1  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2146  hypothetical protein  31.21 
 
 		 150 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.657037 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2102  hypothetical protein  31.21 
 
 		 150 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00782  hypothetical protein  28.81 
 
 		 160 aa  41.6  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2845  hypothetical protein  28.81 
 
 		 149 aa  41.2  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.063186 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0854  hypothetical protein  28.81 
 
 		 160 aa  41.6  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2844  conserved hypothetical protein  28.81 
 
 		 149 aa  41.2  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00765  hypothetical protein  28.81 
 
 		 160 aa  41.6  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>