24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1970 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1970  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  515  1.0000000000000001e-145  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.611932  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5873  hypothetical protein  63.75 
 
 
168 aa  118  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.133238 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2401  hypothetical protein  56.38 
 
 
192 aa  112  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.135537 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1821  hypothetical protein  50.6 
 
 
182 aa  99.4  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.758753  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4523  hypothetical protein  54.43 
 
 
189 aa  98.6  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.584646 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3505  hypothetical protein  58.54 
 
 
173 aa  98.6  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.42017  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2199  hypothetical protein  47.92 
 
 
184 aa  97.8  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.163622  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60590  hypothetical protein  48.39 
 
 
184 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3361  hypothetical protein  53.68 
 
 
187 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.09095  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5219  hypothetical protein  50 
 
 
180 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5761  hypothetical protein  47.92 
 
 
193 aa  93.6  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000051993 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0750  hypothetical protein  45.56 
 
 
175 aa  89.4  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248432  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0151  hypothetical protein  38.3 
 
 
197 aa  87.8  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0152  hypothetical protein  34.86 
 
 
183 aa  85.9  6e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0120146  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0074  hypothetical protein  42 
 
 
182 aa  80.9  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0365  hypothetical protein  36.45 
 
 
263 aa  79.7  0.00000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2022  hypothetical protein  43.33 
 
 
286 aa  78.6  0.00000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00213305  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2927  hypothetical protein  42.55 
 
 
201 aa  76.6  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0506294  normal  0.0176003 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0008  hypothetical protein  37 
 
 
183 aa  75.5  0.0000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2006  hypothetical protein  36.05 
 
 
287 aa  67.8  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.436059  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0053  hypothetical protein  44.3 
 
 
200 aa  67  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3136  hypothetical protein  40.51 
 
 
165 aa  64.7  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5003  hypothetical protein  50.77 
 
 
172 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.468369 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6789  hypothetical protein  46.38 
 
 
161 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>