37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2783 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2783  hypothetical protein  100 
 
 
114 aa  231  3e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0000000347405  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2401  hypothetical protein  60.78 
 
 
192 aa  121  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.135537 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60590  hypothetical protein  58.59 
 
 
184 aa  120  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5219  hypothetical protein  56.86 
 
 
180 aa  120  7e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3361  hypothetical protein  55 
 
 
187 aa  114  5e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.09095  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1821  hypothetical protein  52.88 
 
 
182 aa  114  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.758753  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0750  hypothetical protein  52.43 
 
 
175 aa  114  6e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248432  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0151  hypothetical protein  47.06 
 
 
197 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0152  hypothetical protein  47.06 
 
 
183 aa  111  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0120146  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3505  hypothetical protein  60.82 
 
 
173 aa  110  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.42017  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0365  hypothetical protein  46.23 
 
 
263 aa  110  7.000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5873  hypothetical protein  54.29 
 
 
168 aa  109  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.133238 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0008  hypothetical protein  44.12 
 
 
183 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0074  hypothetical protein  47.62 
 
 
182 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4523  hypothetical protein  54.9 
 
 
189 aa  107  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.584646 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2022  hypothetical protein  51 
 
 
286 aa  107  6e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00213305  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2006  hypothetical protein  46.6 
 
 
287 aa  105  1e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.436059  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2199  hypothetical protein  51.52 
 
 
184 aa  106  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.163622  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5761  hypothetical protein  54.81 
 
 
193 aa  105  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000051993 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2927  hypothetical protein  50.98 
 
 
201 aa  100  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0506294  normal  0.0176003 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6789  hypothetical protein  49.48 
 
 
161 aa  90.9  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3136  hypothetical protein  40.57 
 
 
165 aa  88.2  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5003  hypothetical protein  47.06 
 
 
172 aa  86.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.468369 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06052  conserved hypothetical protein  36 
 
 
732 aa  64.7  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0270  hypothetical protein  35.35 
 
 
157 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677549 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2289  hypothetical protein  36.14 
 
 
157 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1897  hypothetical protein  35.82 
 
 
157 aa  44.3  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2797  hypothetical protein  37.04 
 
 
150 aa  44.3  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.744208  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3165  hypothetical protein  32.04 
 
 
155 aa  43.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0433  hypothetical protein  34.94 
 
 
161 aa  43.5  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0354  hypothetical protein  30.59 
 
 
148 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000171392  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00782  hypothetical protein  30 
 
 
160 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2845  hypothetical protein  30 
 
 
149 aa  41.2  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.063186 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0854  hypothetical protein  30 
 
 
160 aa  41.2  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2448  hypothetical protein  32.1 
 
 
146 aa  41.2  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2844  conserved hypothetical protein  30 
 
 
149 aa  41.2  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00765  hypothetical protein  30 
 
 
160 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>