23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0475 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0475  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  643    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0441686  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0566  hypothetical protein  67.2 
 
 		 349 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.937082  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7496  hypothetical protein  45.75 
 
 		 317 aa  261  6.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1136  RimK domain-containing protein ATP-grasp  26.65 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0604379 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0263  hypothetical protein  28.05 
 
 		 328 aa  55.8  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.744108 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2477  cyanophycin synthetase  26.67 
 
 		 874 aa  52  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2250  cyanophycin synthetase  24.46 
 
 		 856 aa  50.1  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755842  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0565  hypothetical protein  28.24 
 
 		 328 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.328589  normal  0.0737735 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2187  cyanophycin synthetase  26.15 
 
 		 874 aa  49.7  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4152  cyanophycin synthetase  25.68 
 
 		 895 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.38257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0257  cyanophycin synthetase-like  19.84 
 
 		 333 aa  47.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000601246  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2671  cyanophycin synthetase  24.01 
 
 		 896 aa  46.6  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36198  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0874  SSU ribosomal protein S6P modification protein  32.63 
 
 		 292 aa  46.2  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.205884  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0182  alpha-L-glutamate ligase  32.63 
 
 		 292 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1416  cyanophycin synthetase  23.51 
 
 		 743 aa  45.4  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3160  ribosomal protein S6 modification protein  43.48 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5052  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzymes-like  21.1 
 
 		 790 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.46089  normal  0.605241 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  40.68 
 
 		 321 aa  44.3  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1729  alpha-L-glutamate ligase  31.58 
 
 		 292 aa  43.1  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5710  cyanophycin synthetase  24.75 
 
 		 875 aa  43.1  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011022 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2734  hypothetical protein  21.82 
 
 		 340 aa  42.7  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1350  cyanophycin synthetase  26.98 
 
 		 887 aa  42.7  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2607  hypothetical protein  21.82 
 
 		 340 aa  42.4  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>