35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1598 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4509  hypothetical protein  94.96 
 
 
417 aa  675    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.326946 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0978  hypothetical protein  94.96 
 
 
417 aa  671    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.764358  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1486  hypothetical protein  95.68 
 
 
417 aa  684    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1598  hypothetical protein  100 
 
 
417 aa  807    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1754  hypothetical protein  95.68 
 
 
417 aa  672    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.467768 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2547  hypothetical protein  97.6 
 
 
417 aa  697    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0495707  normal  0.214927 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2690  hypothetical protein  97.36 
 
 
649 aa  707    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3158  transposase, IS4 family protein  94.48 
 
 
416 aa  714    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4456  hypothetical protein  94.96 
 
 
417 aa  670    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.185829 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2292  hypothetical protein  41.34 
 
 
185 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0068  transposase, IS4 family protein  28.08 
 
 
397 aa  60.1  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.974421  normal  0.334707 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3427  transposase IS4 family protein  27.55 
 
 
414 aa  57  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000920727  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3220  transposase IS4 family protein  27.55 
 
 
414 aa  57  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.390647  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3071  transposase IS4 family protein  27.55 
 
 
414 aa  57  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.52529  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2890  transposase IS4 family protein  27.55 
 
 
414 aa  57  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0289371  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2872  transposase IS4 family protein  27.55 
 
 
414 aa  57  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2461  transposase IS4 family protein  27.55 
 
 
414 aa  57  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250425  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3532  transposase IS4 family protein  27.55 
 
 
414 aa  57  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000268669  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1934  transposase IS4 family protein  27.55 
 
 
414 aa  57  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000387173  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1209  transposase IS4 family protein  27.55 
 
 
414 aa  57  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0722892  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3610  transposase IS4 family protein  27.55 
 
 
414 aa  57  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0848  transposase IS4 family protein  27.55 
 
 
414 aa  57  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.253852  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3831  transposase IS4 family protein  27.55 
 
 
414 aa  57  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000386672  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4720  transposase IS4 family protein  27.55 
 
 
414 aa  57  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.370488  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4089  transposase IS4 family protein  27.55 
 
 
401 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.034496  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0444  transposase, IS4 family protein  25.81 
 
 
372 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000119461  normal  0.0439577 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1094  transposase IS4 family protein  27.55 
 
 
401 aa  54.7  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0885817  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3939  transposase IS4 family protein  27.55 
 
 
401 aa  54.7  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3112  transposase IS4 family protein  27.24 
 
 
398 aa  54.3  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2039  transposase IS4 family protein  24.8 
 
 
378 aa  50.8  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0411  transposase IS4 family protein  26.52 
 
 
383 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.215728  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0405  transposase IS4 family protein  26.52 
 
 
383 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00559123 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4105  transposase IS4 family protein  24.17 
 
 
384 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5389  transposase IS4 family protein  23.76 
 
 
387 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5516  transposase IS4 family protein  23.76 
 
 
387 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.378571 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>