22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1567 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1567  hypothetical protein  100 
 
 		 431 aa  844    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2652  hypothetical protein  42.11 
 
 		 437 aa  267  2e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1694  30S ribosomal protein S2  42.62 
 
 		 349 aa  52  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.754731 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1367  hypothetical protein  40 
 
 		 272 aa  51.6  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2223  30S ribosomal protein S2  42.19 
 
 		 361 aa  51.6  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1358  putative protein in NADH-ubiquinone oxidoreductase complex  33.96 
 
 		 226 aa  50.1  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1200  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  45 
 
 		 198 aa  49.7  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1460  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  40.91 
 
 		 221 aa  49.7  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0369658 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1719  hypothetical protein  33.57 
 
 		 243 aa  48.9  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2931  hypothetical protein  45.45 
 
 		 157 aa  45.8  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0484753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1266  hypothetical protein  31.19 
 
 		 222 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.502472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1698  30S ribosomal protein S2  34.52 
 
 		 349 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2245  hypothetical protein  34.34 
 
 		 214 aa  45.8  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0103239  normal  0.10945 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2347  30S ribosomal protein S2  29.57 
 
 		 355 aa  44.7  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.473707 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2073  30S ribosomal protein S2  29.57 
 
 		 355 aa  44.7  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.193389  normal  0.160852 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1831  DNA repair and recombination protein RadA  45.95 
 
 		 343 aa  44.7  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4827  30S ribosomal protein S2  32.14 
 
 		 349 aa  44.3  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.356192  normal  0.0170734 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0746  NADH dehydrogenase subunit E  36.11 
 
 		 398 aa  43.5  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.331264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0895  putative NADH dehydrogenase I chain E  37.84 
 
 		 220 aa  43.5  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.256372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3059  hypothetical protein  41.98 
 
 		 626 aa  43.5  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1831  alpha amylase catalytic subunit  56.76 
 
 		 1253 aa  43.1  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.944012 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0211  DNA repair and recombination protein RadA  43.14 
 
 		 343 aa  43.1  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>