36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1144 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3985  YbbR family protein  85.02 
 
 		 451 aa  731    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232234  normal  0.0346134 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1144  YbbR family protein  100 
 
 		 451 aa  858    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2336  YbbR family protein  41.89 
 
 		 443 aa  294  3e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0269901 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3417  YbbR family protein  31.8 
 
 		 459 aa  188  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2247  YbbR-like  27.21 
 
 		 316 aa  97.8  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000736738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0935  YbbR family protein  26.15 
 
 		 396 aa  91.7  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1165  YbbR-like protein  24.87 
 
 		 403 aa  81.6  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0430232  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0149  YbbR family protein  23.71 
 
 		 481 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.948785  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1202  YbbR family protein  28.85 
 
 		 414 aa  77.8  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2345  hypothetical protein  21.94 
 
 		 440 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2659  hypothetical protein  22.2 
 
 		 441 aa  73.6  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0157  YbbR family protein  22.66 
 
 		 411 aa  73.2  0.000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141391  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0833  YbbR family protein  26.51 
 
 		 437 aa  72  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0297295  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0200  hypothetical protein  23.8 
 
 		 495 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0156  hypothetical protein  22.97 
 
 		 495 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0149  hypothetical protein  23.72 
 
 		 493 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0151  hypothetical protein  23.72 
 
 		 493 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0179  hypothetical protein  23.72 
 
 		 493 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0371  YbbR family protein  22.52 
 
 		 311 aa  66.2  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2671  YbbR family protein  25.75 
 
 		 401 aa  64.7  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.825102  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0156  hypothetical protein  23.72 
 
 		 496 aa  64.7  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0157  hypothetical protein  23.72 
 
 		 496 aa  64.7  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0188  hypothetical protein  24.11 
 
 		 493 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.315726  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0150  YbbR family protein  22.76 
 
 		 503 aa  63.5  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0362  YbbR family protein  19.44 
 
 		 410 aa  62.4  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0153  YbbR family protein  23.24 
 
 		 412 aa  61.6  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5136  hypothetical protein  23.72 
 
 		 495 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1287  hypothetical protein  23.89 
 
 		 322 aa  57  0.0000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000141762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0293  YbbR family protein  24.64 
 
 		 334 aa  55.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000188911  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2102  hypothetical protein  22.98 
 
 		 294 aa  54.3  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.659031  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1819  YbbR family protein  25.23 
 
 		 239 aa  53.9  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0241  YbbR family protein  23.88 
 
 		 415 aa  54.3  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3550  hypothetical protein  24.61 
 
 		 413 aa  49.7  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348411  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1231  hypothetical protein  24.84 
 
 		 321 aa  48.9  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0838  YbbR family protein  23.34 
 
 		 408 aa  45.4  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.351314  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1763  hypothetical protein  23.08 
 
 		 311 aa  45.1  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>