26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4284 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4284  bacteriolytic lipoprotein entericidin AB  100 
 
 		 47 aa  94  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3815  entericidin EcnAB  80.85 
 
 		 58 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.823038  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03154  lipoprotein transmembrane  59.57 
 
 		 46 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801084  normal  0.170965 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0290  entericidin precursor lipoprotein  57.45 
 
 		 46 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2234  lipoprotein transmembrane  56.82 
 
 		 44 aa  54.7  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.30503  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4285  Entericidin EcnAB  55.32 
 
 		 46 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4173  Entericidin EcnAB  55.32 
 
 		 46 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.653132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2631  entericidin EcnAB  58.54 
 
 		 44 aa  54.3  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0151  Entericidin EcnAB  53.19 
 
 		 46 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0143  Entericidin EcnAB  51.06 
 
 		 46 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2661  Entericidin EcnAB  47.73 
 
 		 44 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.440397 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1455  hypothetical protein  45.45 
 
 		 62 aa  47  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.199089 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1172  entericidin EcnAB  50 
 
 		 49 aa  45.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.814112  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0239  Entericidin EcnAB  48.84 
 
 		 45 aa  45.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1424  Entericidin EcnAB  51.16 
 
 		 46 aa  42.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2947  entericidin EcnAB  69.23 
 
 		 43 aa  42.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00524222  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2313  entericidin EcnAB  48.78 
 
 		 42 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.54288  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0898  entericidin EcnAB  41.67 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3561  entericidin EcnAB  46.34 
 
 		 44 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.878172  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4806  entericidin EcnAB  46.34 
 
 		 44 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.256769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5477  entericidin EcnAB  46.34 
 
 		 44 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.525479  normal  0.114102 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2002  entericidin EcnAB  46.15 
 
 		 43 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.764034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3799  entericidin EcnAB  46.34 
 
 		 44 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120738 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4767  entericidin AB  46.34 
 
 		 42 aa  40.8  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.718834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1169  entericidin EcnAB  38.3 
 
 		 46 aa  40.8  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000108123  hitchhiker  0.000475974 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1223  entericidin A lipoprotein  38.3 
 
 		 46 aa  40.8  0.007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000610188  normal  0.0180806 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>