60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1971 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1971  putative signal peptide protein  100 
 
 		 158 aa  327  3e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.238735  normal  0.169149 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1998  putative signal peptide protein  74.36 
 
 		 150 aa  180  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2618  hypothetical protein  60.75 
 
 		 175 aa  143  9e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1315  putative signal peptide protein  50.37 
 
 		 141 aa  140  7e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1251  putative signal peptide protein  48.53 
 
 		 141 aa  140  8e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00518719  normal  0.758996 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1190  putative signal peptide protein  48.53 
 
 		 141 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0908829  normal  0.0329477 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3646  hypothetical protein  46.1 
 
 		 139 aa  133  8e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4480  hypothetical protein  37.11 
 
 		 138 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4000  hypothetical protein  36.36 
 
 		 146 aa  80.5  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238971  normal  0.295716 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3517  hypothetical protein  37.11 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0225  hypothetical protein  41.3 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0416  hypothetical protein  40 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0424  hypothetical protein  40 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4106  hypothetical protein  36.08 
 
 		 141 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4260  hypothetical protein  36.08 
 
 		 141 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3417  hypothetical protein  36.08 
 
 		 141 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.549592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2835  hypothetical protein  43.82 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1938  hypothetical protein  32.14 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.228062  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2535  hypothetical protein  36.27 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.753717 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2662  hypothetical protein  36.27 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2644  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1556  hypothetical protein  36 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1468  hypothetical protein  36 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.12597  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2615  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.22957  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2005  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.643515  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0055  hypothetical protein  36 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.705934  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1308  hypothetical protein  33.86 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.153331  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5946  hypothetical protein  33.67 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.458785 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0676  hypothetical protein  34.91 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0683  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.80939  normal  0.421204 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0607  hypothetical protein  30.33 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0807716  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0054  hypothetical protein  33.02 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0311  hypothetical protein  33.02 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2440  hypothetical protein  33.02 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0606  hypothetical protein  33.02 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5613  hypothetical protein  37.21 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0396148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0472  hypothetical protein  33.96 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.323854  normal  0.0568179 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0849  hypothetical protein  33.02 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1014  hypothetical protein  33.02 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0854  hypothetical protein  33.02 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6253  hypothetical protein  26.32 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396801  normal  0.520881 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4546  hypothetical protein  32.38 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0051838 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4413  hypothetical protein  32.38 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.937751 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5871  hypothetical protein  33.33 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.652462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0702  hypothetical protein  30.19 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3264  hypothetical protein  30.19 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.59265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6217  hypothetical protein  32.43 
 
 		 158 aa  52.4  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.229916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1682  hypothetical protein  31.09 
 
 		 135 aa  51.2  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0066  hypothetical protein  30.61 
 
 		 271 aa  50.8  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4398  hypothetical protein  28.18 
 
 		 221 aa  50.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4531  hypothetical protein  28.18 
 
 		 221 aa  50.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.674872  normal  0.0487263 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0317  hypothetical protein  31.68 
 
 		 149 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0165293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1104  putative signal peptide exported protein  34.21 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3525  hypothetical protein  28.46 
 
 		 143 aa  47.4  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.304757  normal  0.481308 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1525  hypothetical protein  28.87 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1891  putative signal peptide exported protein  27.35 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460761  normal  0.629305 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0007  hypothetical protein  28.35 
 
 		 162 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1232  hypothetical protein  29.59 
 
 		 163 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.258059  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1517  hypothetical protein  27.36 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1390  hypothetical protein  31.58 
 
 		 136 aa  42  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>