54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0007 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0007  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  329  9e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0006  hypothetical protein  46.94 
 
 		 170 aa  134  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1517  hypothetical protein  34.21 
 
 		 161 aa  87.4  8e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0472  hypothetical protein  33.04 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.323854  normal  0.0568179 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1166  hypothetical protein  40 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0676  hypothetical protein  35.09 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1682  hypothetical protein  33.04 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3264  hypothetical protein  33.04 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.59265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0702  hypothetical protein  32.14 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5946  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.458785 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0606  hypothetical protein  33.58 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2440  hypothetical protein  33.58 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0054  hypothetical protein  33.58 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0311  hypothetical protein  33.58 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1525  hypothetical protein  26.56 
 
 		 160 aa  68.6  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5871  hypothetical protein  34.85 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.652462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0683  hypothetical protein  34.91 
 
 		 146 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.80939  normal  0.421204 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2644  hypothetical protein  31.58 
 
 		 145 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2005  hypothetical protein  31.58 
 
 		 145 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.643515  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2615  hypothetical protein  31.58 
 
 		 145 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.22957  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0849  hypothetical protein  32.46 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0854  hypothetical protein  32.46 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1014  hypothetical protein  32.46 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6253  hypothetical protein  35.29 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396801  normal  0.520881 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2662  hypothetical protein  33.65 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2535  hypothetical protein  33.65 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.753717 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6217  hypothetical protein  33.33 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.229916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1308  hypothetical protein  33.62 
 
 		 284 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.153331  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1556  hypothetical protein  31.97 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1468  hypothetical protein  31.97 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.12597  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0055  hypothetical protein  31.97 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.705934  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3153  hypothetical protein  29.22 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.232166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2702  hypothetical protein  29.23 
 
 		 147 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.936716 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2561  hypothetical protein  27.92 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1390  hypothetical protein  24.59 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5613  hypothetical protein  31.13 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0396148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0317  hypothetical protein  27.81 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0165293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4413  hypothetical protein  36.54 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.937751 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4546  hypothetical protein  36.54 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0051838 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0416  hypothetical protein  32.8 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0424  hypothetical protein  32 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3525  hypothetical protein  28.95 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.304757  normal  0.481308 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1891  putative signal peptide exported protein  32.76 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460761  normal  0.629305 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4398  hypothetical protein  33.06 
 
 		 221 aa  51.2  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4531  hypothetical protein  33.06 
 
 		 221 aa  51.2  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.674872  normal  0.0487263 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0607  hypothetical protein  33.33 
 
 		 157 aa  50.8  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0807716  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1104  putative signal peptide exported protein  35.8 
 
 		 163 aa  50.8  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1210  hypothetical protein  31.9 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.651462  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1140  hypothetical protein  31.9 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1232  hypothetical protein  30.09 
 
 		 163 aa  48.5  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.258059  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0225  hypothetical protein  31.25 
 
 		 144 aa  48.1  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0066  hypothetical protein  27.62 
 
 		 271 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1998  putative signal peptide protein  29.73 
 
 		 150 aa  42  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2835  hypothetical protein  32.35 
 
 		 158 aa  41.6  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>